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[[File:上方山国家森林公园2.jpg|缩略图|[http://k.sina.com.cn/article_5901595915_15fc3350b0010069bd.html 宁格罗海岸]]]

上方山由于沟谷里水分条件较好，土层深厚，有机质含量较高，排水良好，生境比较湿润，故植物生长繁茂，形成多种中生乔木占优势的杂木林。主要树种有青檀、山胡桃、大叶白腊、蒙桑接骨木、朴树等。此外，还有一定数量的亚热带树种如黄连木、漆树、盐肤木、省沽油等北京地区特有的树种。

上方山有一级名木古树51株，其中千年古树10余株，柏树王、松树王、银杏王、槐树王合称“千年古树四大树王”，树龄都在500年以上，其中四大树王之一柏树王为全山之冠，径粗达到1.53米，高24米，树龄有1500多年，号称北京郊区最粗大的一株大柏树。菩提树、蜡梅更是不可多得。二级古树有4000余株，上方山名木古树品种多，数量大，是北京地区最大的名木古树群。

=== 药用植物 ===