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1930年代，中国结核病高发，而当时上海尚无结核病医院。国立上海医学院院长颜福庆为此多方奔走，向[[社会]]各界募资。1933年2月，颜福庆向其学生叶子衡（巨商叶澄衷之子）谈到上海医学院想筹建一所肺结核病医院。叶子衡乃将自己的私人花园“叶家花园”捐给上海医学院建立第二实习医院 <ref>[http://www.360doc.com/content/16/1201/08/6816362_611128724.shtml 她曾风靡上海滩，如今却“隐藏”政民路一家医院鲜为人知]，360个人图书馆，2016-12-1</ref> ，专收肺科病人。1933年6月15日，澄衷医院国立上海医学院肺病疗养院成立，是上海医学院第二实习[[医院]]，[[颜福庆]]为首任院长。

[[西班牙]]人迭戈·冈萨雷斯·里瓦斯（Diego Gonzalez Rivas）是[[世界]]上首位施行单孔胸腔镜手术的外科医生。2013年，冈萨雷斯作为老师来教上海市肺科医院的医生做单孔胸腔镜手术，当时上海市肺科医院胸外科4位医生合力完成了中国第一例单孔胸腔镜手术 <ref>[http://gov.eastday.com/ldb/node41/node2151/20180601/n69284/n69301/u1ai398746.html 这里的胸外科微创手术量为何世界第一？]，劳动报，2018-5-31 </ref> 。后来，上海市肺科医院成为全球单孔胸腔镜手术的推广中心。2014年到2016年，共有近300名来自美国、西班牙、[[德国]]、荷兰、俄罗斯、[[以色列]]等国的外科医生自费到上海市肺科医院参加为期两周的“单孔胸腔镜”手术学习班，或者为期数月的胸外科全科手术学习班。