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南京五中的前身是国立第二临时中学和南京市青年会中学。1945年10月筹建12月1日开学 <ref>[https://www.sohu.com/a/243917780_356016 40年前的母校，致所有南京人逝去的青春 ]，搜狐，2018-07-28 </ref> 。1946年8月[[学校]]改归市属，更名南京市第五中学。1951年春，南京青年会中学并入南京五中。

五中办学60多年来，为社会培养了数以万计的各类人才。两院院士、核物理学家[[乔登江]]、[[陈达]]，文学家[[周而复]]、 余光中（台湾），[[剧作家]]张弦、沙叶新， 音乐家吴祖强、杨鸿年，北京市长[[郭金龙]]、商务部副部长魏建国等等都是五中校友 <ref>[http://www.gx211.com/school/schoolcontent456.shtml 南京市第五中学【学校简介】]，中国高校之窗</ref> 。正如媒体报道所说：一个中学出了这么多[[科学家]]、文学艺术家和政界名人，在全国鲜见。