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在1990年代，民进党在[[选举]]皆获得逾30%的支持率，但1996年总统选举，首次总统选举民进党落败，仅得21.1%，但因为当时发生台海危机，导致部分选民支持时任总统李登辉所致。
2000年总统选举，由民进党候选人、前[[ 台北| 台北市]]市长[[陈水扁]]以39.3%的得票率当选总统，成为台湾历史上首次的政党轮替。民进党成为中华民国政府的执政党，2004年总统选举，陈水扁总统以50.11%的得票率成功连任，但在民进党8年执政期间，绿营一直未能控制立法院，立法院继续由蓝营控制。
2008年立委选举，绿营失利，仅获得27个立委席次。同年总统选举，民进党失去执政权，由[[中国国民党]]重新执政。