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1949年10月，中华人民共和国成立，两岸分治。为对抗新生的中华人民共和国政府，中华民国在中国领海执行军事封锁——关闭政策。虽然中华人民共和国方面在其它海域逐步突破军事封锁，但在台湾海峡，由于美国的支持和中华民国军事实力强于中华人民共和国的缘故，中华民国得以长期维持关闭政策。解放军海军水面舰艇与民用船舶类似，在1974年前未通过台湾海峡。中国大陆南北调动小型舰艇——鱼雷艇时，一般用火车运输，大型舰艇则以通过台湾岛以东，绕行太平洋的方式进行南北航行。1965年，八六海战和崇武以东海战后，中华民国海军不再对解放军海军主动出击 <ref>[https://bbs.tiexue.net/post2_5846277_1.html 历史考据：中越海战 蒋介石真的说过“西沙战事紧”吗？]，铁血网，2012-05-19</ref> 。

福州军区方面，由军区司令员皮定均负责指挥南下编队通过台湾海峡的行动。副司令员朱绍清等人则组成福州军区工作组，在编队抵达前赶赴福建沙埕港。得到中央军委批准后，皮定均下令：海军福建基地组织多支护卫艇、鱼雷艇编队进入沙埕、东冲、东山、崇武等8个港口内待命出击；福建海岸炮兵进入阵地，做好射击的准备；福建沿海海空军雷达站全线开机，掌握编队在台湾海峡的舰位和空情；海军福建基地派出有经验的航海人员，为编队领航；驻闽空军在福州、漳州机场的歼击机进入起飞待命状态，飞行员要坐在座舱里，等待命令起飞；福州军区技侦部队加强对台湾海空军部队调动出动情况的掌握；所有担负掩护任务的部队进入一级战斗准备，担负任务的领导干部一律坚守岗位。并要求上述部署在1月21日16时前到位 <ref>[https://mil.huanqiu.com/article/9CaKrnJJ9xY 揭秘：人民海军舰队首次通过台湾海峡始末]，环球网，2015-03-24</ref> 。