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由于是英国海外领地，因此英女王伊莉沙白二世是英属印度洋领地的元首。现在岛上约3500的人口都是英美两国派驻的军人或相关的承包商，并没有真正的居民，因此英女王并无指派英属印度洋领地的总督（Governor），而是以专员（Commissioner）与担任其助手的行政官（Administrator）作为英属印度洋领地的政府首脑。现任专员为Leigh Turner，行政官为2005年2月上任的东尼·罕弗利（Tony Humphries）。有别于一般政府首脑应居于管辖地的常情，英属印度洋领地专员自1970年代之后就再也未曾居住在当地，而是居住在英国本土。迪戈加西亚岛本住有原居民，但美国不顾原居民意愿，在英国的协助下，在1965年—1973年期间把全部原居民强行迁走。英美两国都没有为他们作出像样的安置，不少人只好流浪街头，贫病交逼，有原居民因而想返回迪戈加西亚岛生活，但全被拒绝。