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也有不少问题已浮现，包括使驾驶员分心。但该iPad上的互联网不能在那些高度上使用，以及飞行员仍将使用机载GPS仪器。其他安全问题包括软件故障或断电，但在进行三个月的Executive Jet Management测试中，没有发生应用程序关闭或故障。测试显示，如果发生故障，程序可以在4至6秒内重新启动。驾驶舱中额外的iPad也被视为系统故障的备份。航空公司也还在研究iPad在驾驶舱中的安全性。最受欢迎的放置方法是在飞行员膝上板上，这使用一个背带将它连接到飞行员的大腿而使设备免提，但许多商业航空公司也在寻找一个将其连接到飞机本身的坞站。