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在盟军司令部（GHQ）结束日本的航空禁令后，当时的通商产业省主导成立“输送机设计研究协会”（简称“输研”），这是“日本航空机制造株式会社”（NAMC）的前身 <ref>[http://mil.news.sina.com.cn/2009-12-31/0755579194.html 日本国产YS-11E军机曾侦察朝鲜大浦洞导弹发射]，新浪网， 2009-12-31</ref> 。NAMC是由几家大型的重工业公司合作成立，分别是新三菱重工（后来的三菱重工）、富士重工（汽车部门即为Subaru汽车）、川崎重工、新明和工业、昭和飞行机、日本飞行机，而由三菱重工主导。有些公司在第二次世界大战结束前就已经生产过军用飞机或相关军品。

在日本国内，已没有现役民用的YS-11，日本航空的子公司日本空中通勤（Japan Air Commuter, JAC）是最后以此机种进行日本国内民用飞行的公司，但已经于2006年9月30日之后全部停飞 <ref>[https://www.sohu.com/a/341982517_223764 日本雅虎出现二手飞机售卖帖 网友：就算买得起也养不起] ，搜狐，2019-09-19</ref> 。停飞原因是因为日本的国土交通省要求国内的航空公司在其民航飞机都要加装TCAS（飞机防互撞警告系统）。未加装TCAS的飞机只能飞到2006年底。而加装给YS-11的TCAS一架要花费1亿日圆（93万美元，依照1USD = 107JPY计算），对于YS-11这种年代久远的飞机来说并不划算，因此航空公司是引进新机种取代它。停飞后的YS-11除了报废解体及公开展览外，尚于适航状态的飞机则卖给国外的航空公司。