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2007年9月青岛海洋科学与技术国家实验室建设方案正式通过由国务院委托科技部、财政部组织的国家论证。在两天时间里，由科技部、财政部组织的专家听取并审阅了国家实验室筹备组关于实验室建设方案的总报告、8个功能实验室的分报告、公共实验平台和技术支撑体系的综合报告。经过讨论，专家组形成了“同意国家实验室的建设方案，建议尽快批准实施”的意见。专家组的意见指出，青岛地区汇聚了国内一批具有较强优势的海洋科技力量，承担了大量的国家海洋科技重大任务，为我国海洋科技事业发展作出了重要贡献。围绕国家重大战略目标，在青岛建设国家实验室是落实《国家中长期科学和技术发展规划纲要（2006-2020年）》的重要举措，对增强我国海洋科技自主创新能力、探索科技管理体制改革的新模式意义重大，具有紧迫性。专家组认为，国家实验室利用筹建单位现有优势和基础，提出的建设方案符合我国海洋科技发展需要，并在管理体制和运行机制上提出了新的思路，框架结构和运行模式基本符合当前科技体制下国家实验室建设的要求。各理事单位提出的8个功能实验室和3个技术支撑体系的建设，体现了资源整合的思想，有利于更充分发挥现有资源的功能和作用，可望对国家实验室的建设奠定重要基础。提出的新建6个面向国内外开放共享的公共实验平台设想，将提升国家实验室的能力，对推动全国海洋科技发展具有积极作用。