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2004年医院成为浙江中医学院、温州医学院和江西中医学院的教学医院，2008年成为[[浙江中医药大学]]附属医院，2015年成为福建中医药大学附属医院。2007年被列为浙江省中医药攀登工程名院建设单位，中医妇科、肾病科、肝病科被列为名科建设对象。医院[[学科]]地区辐射性强，现有国家级重点专科4个——中医妇科、肾病科、康复科、神志病科；省中医重点学(专)科9个——中医妇科、肾病科、中西医结合老年康复科、肝病科、针推康复科、脑病科、脾胃病科（消化科）、骨伤科、护理学 <ref>[https://www.sohu.com/a/259204249_359560 护理学：国外目前就业率最高的专业之一]，搜狐，2018-10-13 </ref> ；市级重点学科群4个——老年病学科群、康复医学学科群、心脑血管学科群、骨伤学科群；市级重点学科8个——心脑血管科、康复科、骨伤科、中西医结合乳腺病科、中西医结合消化内科、中西医结合肿瘤内科、针灸推拿科、检验科。保持了在地区[[中医药]]发展建设中的领先地位。