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医院医疗、教学、科研相得益彰，是福建医科大学、福建中医药大学教学医院。2004年医院与莆田学院临床医学系实现院系合一，现为莆田学院附属临床学院，设有7个医学研究所、16个临床教研室，1个医学博士联合培养点，9个医学硕士联合培养点。医院与时俱进，不断加大学科建设力度，以骨科、呼吸与危重症医学科2个省级重点专科以及胸心外科、感染性疾病科、儿童重症医学科等9个市级重点学科为龙头，积极开展新技术、新疗法、新项目，带动各临床学科全面发展，形成“院有品牌，科有特色，人有专长”的人才技术层次。共有国家自然科学基金项目1项，卫生部科技二等奖1项，省政府科技二等奖、三等奖3项，省医药卫生及护理科技奖2项，先后有70多项科研项目获市级科技进步奖。同时建立了福建省儿童救治和产前筛查诊断莆田分中心、莆田市生殖医学中心。