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医院共获得国家自然科学奖二等奖1项，国家科技进步二等奖1项，教育部高等学校科学研究优秀成果奖一等奖2项，省部级科研奖30项，承担省部级以上课题1397项，其中国家级项目289项，省部级项目1108项；近五年发表学术论文7432余篇，其中SCI文章2881篇。2017年发表SCI文章542篇，2018年发表SCI文章638篇，2019年发表SCI文章755篇；2019国家自然基金委公布的数字显示，我院立项数目达到61项，连续五年蝉联吉林大学第一名。承担“十三五”国家重点研发专项2项、“973”项目4项、获[[国家自然科学基金]]优秀青年科学基金资助项目2项。2019年获批[[教育部]]“器官再造与移植”重点实验室，2013年获[[国家发改委]]批准建立“人类疾病动物模型国家地方联合工程实验室”，2014年获科技部批准成立“表观遗传医药与人类疾病动物模型国际联合研究中心”。

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