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中国农业科学院上海兽医研究所的前身为中国农业科学院家畜血吸虫病研究室，成立于1964年10月。1982年2月更名为中国农科院上海家畜血吸虫病研究所。1989年7月更名为中国农科院上海家畜寄生虫病研究所。2006年3月更名为中国农业科学院上海兽医研究所，加挂中国动物卫生与流行病学中心上海分中心牌子。
研究所主要开展动物传染病、动物寄生虫病和动物药物研究；主要研究领域是动物传染病、动物寄生虫病和兽用药物；主要方向任务是以危害严重的猪、禽传染病、动物寄生虫病、人畜共患病和兽用药物等为研究对象，开展病原生物学、分子流行病学、病原感染致病与免疫机制、诊断及防控技术等基础与应用基础研究；研制开发安全高效的新型动物疫苗、治疗药物和新制剂、快速简便的疫病诊断技术及制剂。
据2017年12月研究所官网显示，研究所设有6个研究室，拥有国家级工程技术研究中心1个、国家级实验室1个、农业部实验室3个、中国农业科学院实验室1个；共有在职职工124名，其中科研人员89名；设有2个学术学位二级学科博士点、3个学术学位二级学科硕士点。
==历史沿革==
1964年10月，中国农业科学院家畜血吸虫病研究室成立。
1981年，研究所被国务院学位委员会批准为首批硕士学位培养点。
1982年2月，中国农业科学院家畜血吸虫病研究室更名为中国农科院上海家畜血吸虫病研究所。
1984年，研究所被批准为博士学位培养点。
1988年，研究所组建了药化研究室。
1989年7月，中国农科院上海家畜血吸虫病研究所更名为中国农科院上海家畜寄生虫病研究所。
1996年11月，在研究所的基础上组建了农业部动物寄生虫学重点开放实验室。
1999年，研究所建立博士后流动站。
2000年1月在研究所的基础上组建了上海动物生物技术研究中心。
2004年，在所的基础上组建了国家防治动物血吸虫病专业实验室和动物传染病防治研究室。
2006年3月，中国农科院上海家畜寄生虫病研究所更名为中国农业科学院上海兽医研究所，加挂中国动物卫生与流行病学中心上海分中心牌子。
2013年10月，研究所正式加入中国农业科学院科技创新工程。
2017年11月，获评为第五届全国文明单位。
研究所主要开展动物传染病、动物寄生虫病和动物药物研究；主要研究领域是动物传染病、动物寄生虫病和兽用药物；主要方向任务是以危害严重的猪、禽传染病、动物寄生虫病、人畜共患病和兽用药物等为研究对象，开展病原生物学、分子流行病学、病原感染致病与免疫机制、诊断及防控技术等基础与应用基础研究；研制开发安全高效的新型动物疫苗、治疗药物和新制剂、快速简便的疫病诊断技术及制剂。
据2017年12月研究所官网显示，研究所设有6个研究室，拥有国家级工程技术研究中心1个、国家级实验室1个、农业部实验室3个、中国农业科学院实验室1个；共有在职职工124名，其中科研人员89名；设有2个学术学位二级学科博士点、3个学术学位二级学科硕士点。
==历史沿革==
1964年10月，中国农业科学院家畜血吸虫病研究室成立。
1981年，研究所被国务院学位委员会批准为首批硕士学位培养点。
1982年2月，中国农业科学院家畜血吸虫病研究室更名为中国农科院上海家畜血吸虫病研究所。
1984年，研究所被批准为博士学位培养点。
1988年，研究所组建了药化研究室。
1989年7月，中国农科院上海家畜血吸虫病研究所更名为中国农科院上海家畜寄生虫病研究所。
1996年11月，在研究所的基础上组建了农业部动物寄生虫学重点开放实验室。
1999年，研究所建立博士后流动站。
2000年1月在研究所的基础上组建了上海动物生物技术研究中心。
2004年，在所的基础上组建了国家防治动物血吸虫病专业实验室和动物传染病防治研究室。
2006年3月，中国农科院上海家畜寄生虫病研究所更名为中国农业科学院上海兽医研究所，加挂中国动物卫生与流行病学中心上海分中心牌子。
2013年10月，研究所正式加入中国农业科学院科技创新工程。
2017年11月，获评为第五届全国文明单位。