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北京大学分子医学研究所（Institute of Molecular Medicine, Peking University, IMM PKU）是985II期建设标志性的、向国际开放、多学科交叉的研究机构。建所之初，以心血管疾病研究为中心布局，集基础研究-技术转化-临床前研究为一体，体现“从分子到人” 一条龙的研究战略，并设立理学博士和医学/理学博士（筹划中）培养计划。