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新海三期人工溼地原址地貌為河岸灘地與禾本科草生地為主，溼地建置後主要分為草澤溼地及水田環境。根據99年度調查發現斑嘴鴨、紅冠水雞偏好於草澤溼地內水生植物遮蔽之區域。長腳鷸、小環頸鴴、鷹斑鷸等鷸鴴科鳥類偏好出現於水生經濟作物區之環境。
==淨水功臣==
溼地裡的水生植物，可以說是淨化水質的大功臣，依照在水中生長姿態的不同，可分為挺水、浮葉、漂浮、沉水植物。每一種類型的水生植物，除汙的效果也都有差別，以挺水及浮葉植物為例，它們的葉片生長在水面上，根部深入水底，葉片吸收空氣後，再經由莖部和根部，帶進到水底的土壤中，讓好氧細菌可以進行汙染物的分解作用。
另外， 浮萍、滿江紅等漂浮植物，能夠吸收水中過多的有機氮、磷；沉水植物除了同樣可以降低有機氮、磷含量外，還可增加水中溶氧，使汙染物得以完全分解。
不過，雖然是模仿自然，但畢竟人工溼地是為了淨水功能而建，它的淨水能力必須更強才行，因此在許多地方的設計有別於自然溼地，最明顯的不同處，就是人工溼地不是單一一個池子，而是許多池子串連起來的。人類產生的廢水被引進來之後，會逐一流經每一個池子，每一個池子都種植了不同的水生植物組合，可以過濾不同的汙染物。最後濾清的水源再排放進大漢溪裡，不會造成汙染。
到底人工溼地和一般的汙水處理場的差別在哪裡呢？以處理相同水量的標準來說，人工溼地的面積大約是汙水處理廠的5.10倍，但所需的人工及材料成本，只有汙水廠的20.30%。後續的操作成本也比較低，所耗的電力只有汙水廠的十分之一。