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2014年設立長期照護輔具中心，及聖母樂齡健康活力中心。同年12月16日陳良娟接任台東聖母醫院第七任院長<ref name="臺東聖母醫院1"/>。2016年7月[[颱風尼伯特_(2016年)|強烈颱風尼伯特]]於8日凌晨自臺東[[太麻里]]海岸登陸，其夾帶之強勁風勢造成臺東市區災情慘重，[[中央氣象局]][[臺東氣象站]]更是測得自1901年設站以來最大陣風紀錄<ref name="中時電子報3"/>，也造成該氣象站設備損壞，台東聖母醫院於尼伯特颱風侵襲期間亦受到嚴重損害，轄下之位於知本地區的聖母健康農莊窗戶[[玻璃]]破損，導致風雨灌入[[廚房]]，亦將種植有機作物的網室摧毀<ref name="信傳媒"/>。初步估算，含醫院本部在內的損失估計約有500萬元，不過後續經過一週的環境整理與清點計算，損失估計攀升接近千萬元，對於營運狀況本已不佳的聖母醫院來說可是雪上加霜<ref name="信傳媒"/>。為此聖母醫院為籌措重建基金，在院內修女帶領下於7月21日起展開祈福[[蛋糕]]義賣<ref name="中時電子報2"/>。2018年4月4日台東聖母醫院新增[[中醫]]科門診。同年4月28日聖母健康農莊新園開幕暨高齡服務中心啟用<ref name="臺東聖母醫院1"/>。

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