中医研究院良好的工作环境，给了郑氏父子良好的发展平台和无比的动力。他们只争朝夕总结五世秘传经验，并多次到政务院医务室给中央领导周恩来、李富春、李先念等治病，何香凝老人亲绘“梅花傲雪”扇面相赠，周总理亲切邀请他们到家共进晚餐，并表扬父子两人的业绩，要精益求精更好地服务于人民。自1956年始，周总理每年国庆节都邀请郑毓琳父子在天安门城楼上观礼。

经络学说一直是中医学重要的基本理论，更是针灸科研与临床实践的理论依据。现代西医学因找不到经络的解剖实质，就怀疑甚至抨击经络学说理论的科学性，称之为谬论和伪科学。上世纪50年代，以郑毓琳、承淡安、郑魁山等权威针灸专家为首倡的“经络实质研究”蓬勃兴起。1960年郑魁山与北京协和医院等10家医院协作研究经络实质，任组长。这些早期的研究活动，为70年代后期针灸学者的后续研究奠定了基础，指明了方向。