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# 1891年，小昆仲會的[[修士]]到[[天津]]和[[北京]]，負責各地主要大學及高等學府的教務。1893年，修士到[[上海]]的[[耶穌會]][[聖芳濟書院 (上海)|聖芳濟書院]]接管教務工作 。1895 。# 1895 年，修士接管了整個學校的校務<ref name="轶史">{{Cite web |url=http://www.jashidai.edu.sh.cn/pages/pages.aspx?id=9&page=9 |title=圣芳济轶史 - 上海市时代中学 |access-date=2015-04-24 |archive-url=https://web.archive.org/web/20160304105148/http://www.jashidai.edu.sh.cn/pages/pages.aspx?id=9&page=9 |archive-date=2016-03-04 |dead-url=yes }}</ref> 。1950 。# 1950 年，[[中華人民共和國]]成立後將所有[[中国天主教#中华人民共和国|外國教會人士驅逐出境]]。在上海聖芳濟書院任教的修士倉皇逃難到香港，於[[九龍城]][[嘉林邊道]]聖馬丁書院任教<ref name="竇安寧">[http://archives.catholic.org.hk/In%20Memoriam/Clergy-Brother/K-Doheny.htm 竇安寧修士 - 天主教香港教區]</ref>。 # 1954年，[[香港教育署]]原本將現為[[伊利沙伯中學]]的地皮供修會建造校舍，及後知悉修會幾近身無分文，無法在山坡上建校，遂改為給予修會兩個選擇：在[[清水灣]]或[[大角咀]]建立校舍。最後，修士們於[[九龍]][[楓樹街]]和[[詩歌舞街]]交界處（當時被稱為九龍內地段6421（K.I.L. 6421））建立校舍。嘉林邊道的校舍同告棄置，同學被安排至九龍[[鄧鏡波學校]]暫時上課 。1955 。# 1955 年12月9日，新建的學校啟用，為表示與上海母校（上海聖芳濟書院，即現在的上海北虹中學）的關係，便將學校命名為「聖芳濟書院」。至今，學校正門的「九龍內地段6421」地界仍然被保留。