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<p style="text-indent: 30px; line-height:30px">總督府臺北高校是當時台灣高等中學校中的最高學府，在臺北高校時期，經常有日本學生欺壓台灣學生的事件，激起台籍學生反日思想，1941年太平洋戰爭爆發，郭琇琮與臺北高校的同學[[蔡忠恕]]響應祖國抗日 <ref name="1500kmeter">{{cite book|title=尋找祖國三千里|publisher=台灣人民出版社|author=藍博洲|date=2010-09-01}}</ref> ，在臺北帝國大學成立學生反日組織，1944年學生間諜西山光世向憲兵檢舉台灣學生將日皇及皇太子照片故意從頭部切斷，密報[[謝娥]]與臺北高校及帝大學生秘密集會，結果被[[日本]]憲兵逮捕，郭琇琮遭判刑5年，1945年8月日本戰敗，郭琇琮獲釋，參加[[國立台灣大學]]畢業考完成學業。<ref name="biography"/></p>