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==物種危機==
近年來，由於柴山開放民眾自由進出，也造成私闢休息區泛濫，外來登山客不斷引入園藝植物栽植，以致長期下來已有多種園藝植物入侵柴山森林，其中以[[黃金葛]]、吊竹草最為嚴重，此二種植物可以進入原生林的地被，形成優勢之族群並擠壓原生植物的生存空間 ，導致植被單一化<ref></ref>。 .
另外，《聯合新聞網》報導，2005年4月7日。{{zh-tw}}</ref>，甚或因向遊客或當地居民搶食甚而咬傷遊客的情況時有所聞。且由於長期的餵食，導致獼猴數量激增並衝擊猴群間原始的互動，已嚴重影響柴山上獼猴健康的成長，慢慢喪失了在森林中覓食的能力。且部分柴山獼猴被台灣[[農委會]]家畜衛生試驗所檢驗出感染人畜共通的'''猿猴B病毒'''，更增加與人類與獼猴間接觸的風險。<ref>，《聯合新聞網》報導，2005年2月22日。{{zh-tw}}</ref>而除人畜接觸產生的疾病與猴群原始覓食的問題之外，由於猴群生活習性的改變，與人類社區互動的情形日益頻繁，也增加了其他衍生的社會問題<ref>。