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1999年，《计算机集成制造系统》在 [[ 中国科技论文与引文数据库 ]] 中，年度影响因子0.746，被引频次162次；2001年影响因子0.843，被引频次310次；2004年影响因子0.855，在计算机类期刊中排名第3名。2010年影响因子1.081，总被引频次2466次，他引率0.83次；2013年影响因子0.842，总被引频次2285次，在计算机类期刊中排名第3名。在中国学术期刊综合引证报告中，2001年～2003年影响因子0.7492，被引频次495次；2004年影响因子0.8395，被引频次722次，在计算机类期刊中名列第3名；2005年度影响因子1.084，成为该领域首次突破1的期刊。2013年复合影响 [[ 因 子1子]]1.866、学科排名4/117名，期刊综合影响因子0.977、学科排名4/103名，技术研究类影响因子0.903、学科排名2/71名 [1] 。

2013年9月，《中国科技期刊引证报告》核心版中，《计算机集成制造系统》的影响因子首次突破1，达到1.007，总被引频次达到2238次，在 [[ 计算机技术 ]] 类期刊中排名第3名；在同期出版的《中国科技期刊引证报告》扩刊版中，2012年的影响因子高达1.236，总被引频次达到2985次。2013年公布的中国知网学术期刊综合评价数据库中，《计算机集成制造系统》期刊2012年的复合影响因子1.797，复合总被引频次7085次，影响因子在同类117种期刊中排名第4名。

据2019年6月1日中国知网显示，《计算机集成制造系统》总被 [[ 下 载2271042 载]]2271042 次，总被引120356次，（2018版）复合影响因子为1.935，（2018版）综合影响因子为1.099。

据2019年6月1日 [[ 万方数据知识服务平台 ]] 显示，《计算机集成制造系统》被引量为91644次，下载量为405820次；据2015年中国期刊引证报告（扩刊版）数据显示，《计算机集成制造系统》影响因子为1.09，在全部统计源期刊（6735种）中排第861名，在自动化技术与计算机技术类排名（94种）中排第11名。

1996年1月26日，《计算机集成制造系统》期刊获准被 [[ 美国 ]] 工程索引《Ei Compendex》数据库收录 [5] 。