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菌种鉴定
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[[File:T01779f4df58672f897.jpg|缩略图|居中|[https://p1.ssl.qhimg.com/t01779f4df58672f897.jpg 原图链接][https://baike.so.com/gallery/list?ghid=first&pic_idx=1&eid=4310739&sid=4514709 来自 360 的图片]]]
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菌种鉴定一般就只要提取基因组DNA，[[然后]]PCR扩增16s rDNA片段，上GeneBank或者Eztaxon对比即可。一般序列相似度在97%以上就可以认为是同种细菌(当然也有例外，DNA序列仅仅是一个参考指标)。
=='''基本信息'''==
中文名；
菌种鉴定
功能鉴定；
技术分析等
其他手段；
可根据特殊要求提供[[相应]]的服务
常规鉴定；
形态特征和理化[[特性]]
鉴定手段；
折叠常规鉴定
常规鉴定内容有形态特征和理化特性。形态特征包括显微形态和培养特征;理化特性包括营养类型、碳氮源利用能力、各种代谢反应、酶反应和血清学反应等。
自动鉴定
BIOLOG鉴定系统以微生物对不同碳源的利用情况为基础，检测微生物的特征指纹图谱，建立与微生物种类相对应的数据库。通过软件将待测微生物与数据库参比，得出鉴定结果。该系统已获美国FDA认可，已逐步应用于食品和饮品企业、环保、海洋生物/水产品、制药、农业微生物、生物治理、化妆品、临床等领域的微生物鉴定试验中。 CICC拥有国内最全的BIOLOG数据库，涉及[[革兰氏阴性菌]]、革兰氏阳性菌、厌氧菌、酵母、丝状真菌在内近2000种微生物。
分子生物学鉴定
应用分子生物学方法从遗传进化角度阐明微生物种群之间的分类学[[关系]]，是微生物分类学研究普遍采用的鉴定方法。CICC拥有微生物菌种分类鉴定的分子生物学实验室，配有PCR仪、高速冷冻离心机、电泳仪、HPLC、凝胶成像系统、紫外控温分析系统等先进仪器设备，以及DNAMAN、BIOEDIT、CLUSTALX、TREEVIEW等序列分析软件。CICC可采用核酸序列分析法分析细菌16S rDNA/16S-23S rDNA区间序列、酵母18S rDNA/26S rDNA(D1/D2)序列及丝状真菌的18S rDNA/ ITS1-5.8S-ITS2序列，提供科学的鉴定结果。
API细菌鉴定
API鉴定系统涵盖15个鉴定系列，约有1000种生化反应，已可鉴定超过600种的细菌。鉴定过程中，可根据细菌所属类群选择适当的生理生化鉴定系列，通过软件将待测细菌与数据库参比，得出鉴定结果。 CICC可应用API 50CH系列、API 20 E系列、API Staph系列对乳酸杆菌(Lactobacillus sp.)和相关细菌、芽孢杆菌(Bacillus sp.)、葡萄球菌属(Staphylococcus sp.)、微球菌属(Micrococcus sp.)和库克菌属(Locuria sp.)进行鉴定。
=='''功能鉴定'''==
技术分析
功能性分析及功能基因CICC不断致力于工业微生物资源的功能及其功能基因研究，通过[[木聚糖酶]]、纤维素酶、葡萄糖异构酶、β-甘露聚糖酶等功能基因的克隆进行菌种产酶的功能性分析。应用gyrA、atpD及pheS等看家基因于微生物菌种鉴定，在某些种、亚种、株间有较好的分辨效果。
RAPD、SSCP技术 随着微生物菌种应用的进一步发展，在食品安全管理、生物产品出口认证、知识产权保护等行业需求日益增加，微生物菌种株水平的鉴别技术成为一个迫切需要解决的问题。 CICC采用随机扩增多态性DNA(Randomly amplified polymorphism DNA，RAPD)技术和单链构象多态性(Single Strand Conformation Polymorphism，SSCP)技术对微生物菌株进行鉴别。如采用RAPD技术能够对同一菌种原始菌株与诱变菌株进行鉴别，对诱变菌株知识产权保护具有重要意义;采用SSCP技术进行工业酒精酵母菌株的鉴别，此技术结合菌株发酵特性，在酒类生产的质量控制方面起到积极作用。
TLC薄层层析CICC将TLC薄层层析技术应用于微生物菌种鉴定，进行细菌、放线菌[[细胞]]壁化学组分分析(氨基酸、糖)，作为划分属特征的重要鉴定技术手段，起到了良好的辅助作用。
全细胞脂肪酸分析鉴定系统 采用Sherlock全自动[[细菌]]鉴定系统，通过对不同菌株的脂肪酸图谱进行分析，并与标准数据库进行比对，来鉴定细菌及酵母。该技术是细菌或酵母种水平鉴定的有效手段之一。(9)(G+C)mol%及DNA/DNA杂交 CICC通过采用DU800核酸蛋白分析仪测定Tm值，从而得到微生物菌株的(G+C)mol%，并与模式菌株进行DNA/DNA同源性分析，该鉴定技术手段是多相鉴定的重要组成部分。<ref>[https://www.docin.com/p-273146433.html 菌种鉴定流程 ], 快资讯 , 2011-10-14</ref>
=='''参考文献'''==
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菌种鉴定一般就只要提取基因组DNA，[[然后]]PCR扩增16s rDNA片段，上GeneBank或者Eztaxon对比即可。一般序列相似度在97%以上就可以认为是同种细菌(当然也有例外，DNA序列仅仅是一个参考指标)。
=='''基本信息'''==
中文名；
菌种鉴定
功能鉴定；
技术分析等
其他手段；
可根据特殊要求提供[[相应]]的服务
常规鉴定；
形态特征和理化[[特性]]
鉴定手段；
折叠常规鉴定
常规鉴定内容有形态特征和理化特性。形态特征包括显微形态和培养特征;理化特性包括营养类型、碳氮源利用能力、各种代谢反应、酶反应和血清学反应等。
自动鉴定
BIOLOG鉴定系统以微生物对不同碳源的利用情况为基础，检测微生物的特征指纹图谱，建立与微生物种类相对应的数据库。通过软件将待测微生物与数据库参比，得出鉴定结果。该系统已获美国FDA认可，已逐步应用于食品和饮品企业、环保、海洋生物/水产品、制药、农业微生物、生物治理、化妆品、临床等领域的微生物鉴定试验中。 CICC拥有国内最全的BIOLOG数据库，涉及[[革兰氏阴性菌]]、革兰氏阳性菌、厌氧菌、酵母、丝状真菌在内近2000种微生物。
分子生物学鉴定
应用分子生物学方法从遗传进化角度阐明微生物种群之间的分类学[[关系]]，是微生物分类学研究普遍采用的鉴定方法。CICC拥有微生物菌种分类鉴定的分子生物学实验室，配有PCR仪、高速冷冻离心机、电泳仪、HPLC、凝胶成像系统、紫外控温分析系统等先进仪器设备，以及DNAMAN、BIOEDIT、CLUSTALX、TREEVIEW等序列分析软件。CICC可采用核酸序列分析法分析细菌16S rDNA/16S-23S rDNA区间序列、酵母18S rDNA/26S rDNA(D1/D2)序列及丝状真菌的18S rDNA/ ITS1-5.8S-ITS2序列，提供科学的鉴定结果。
API细菌鉴定
API鉴定系统涵盖15个鉴定系列，约有1000种生化反应，已可鉴定超过600种的细菌。鉴定过程中，可根据细菌所属类群选择适当的生理生化鉴定系列，通过软件将待测细菌与数据库参比，得出鉴定结果。 CICC可应用API 50CH系列、API 20 E系列、API Staph系列对乳酸杆菌(Lactobacillus sp.)和相关细菌、芽孢杆菌(Bacillus sp.)、葡萄球菌属(Staphylococcus sp.)、微球菌属(Micrococcus sp.)和库克菌属(Locuria sp.)进行鉴定。
=='''功能鉴定'''==
技术分析
功能性分析及功能基因CICC不断致力于工业微生物资源的功能及其功能基因研究，通过[[木聚糖酶]]、纤维素酶、葡萄糖异构酶、β-甘露聚糖酶等功能基因的克隆进行菌种产酶的功能性分析。应用gyrA、atpD及pheS等看家基因于微生物菌种鉴定，在某些种、亚种、株间有较好的分辨效果。
RAPD、SSCP技术 随着微生物菌种应用的进一步发展，在食品安全管理、生物产品出口认证、知识产权保护等行业需求日益增加，微生物菌种株水平的鉴别技术成为一个迫切需要解决的问题。 CICC采用随机扩增多态性DNA(Randomly amplified polymorphism DNA，RAPD)技术和单链构象多态性(Single Strand Conformation Polymorphism，SSCP)技术对微生物菌株进行鉴别。如采用RAPD技术能够对同一菌种原始菌株与诱变菌株进行鉴别，对诱变菌株知识产权保护具有重要意义;采用SSCP技术进行工业酒精酵母菌株的鉴别，此技术结合菌株发酵特性，在酒类生产的质量控制方面起到积极作用。
TLC薄层层析CICC将TLC薄层层析技术应用于微生物菌种鉴定，进行细菌、放线菌[[细胞]]壁化学组分分析(氨基酸、糖)，作为划分属特征的重要鉴定技术手段，起到了良好的辅助作用。
全细胞脂肪酸分析鉴定系统 采用Sherlock全自动[[细菌]]鉴定系统，通过对不同菌株的脂肪酸图谱进行分析，并与标准数据库进行比对，来鉴定细菌及酵母。该技术是细菌或酵母种水平鉴定的有效手段之一。(9)(G+C)mol%及DNA/DNA杂交 CICC通过采用DU800核酸蛋白分析仪测定Tm值，从而得到微生物菌株的(G+C)mol%，并与模式菌株进行DNA/DNA同源性分析，该鉴定技术手段是多相鉴定的重要组成部分。<ref>[https://www.docin.com/p-273146433.html 菌种鉴定流程 ], 快资讯 , 2011-10-14</ref>
=='''参考文献'''==
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