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巫醫師於2018年1月18日安然辭世，享壽84歲。生前鉅大貢獻是致力將中醫納入健保，爭取中醫師特考，催生國內首間公立中醫醫院，為中醫界爭取勞保擴大給付等等，才讓中醫在健保給付方面與西醫得到平等待遇，可以說是「台灣中醫界巨人」、「中醫領航者」。中華民國中醫師公會全國聯合會第九屆理事長何永成讚揚巫醫師在擔任全聯會理事長六年期間，為中醫師謀求權益及爭取平等地位，以中醫興亡為己任，置個人得失於度外，是「台灣中醫歷史上的改革者」 <ref>[https://www.ct.org.tw/1318799#ixzz5gnTkRFxg 【中醫納入健保的推手】台灣中醫界的巨人　巫水生醫師安息主懷]基督教論壇報/全球華人新聞網，2018-02-17</ref> 。