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土合站位於[[三國山脈]]中[[谷川岳]]的腳下，同時也是群馬縣內的普通鐵道火車站中位於最北方的一座。該站最大的特點是下行月台位於[[清水隧道 (日本)|新清水隧道]]內，因上下車人數相當少，所以未設[[電扶梯]]或[[電梯]]<ref>[http://ridgelineimages.com/sightseeing/doai-station-journey-japans-deepest-station/ Doai Station: Journey to Japan's Deepest Statio]，30 January 2018</ref>，要出站或者前往上行月台的話，必須先爬上一條462級、長338公尺的樓梯，然後經過一條143公尺長、24個梯級高的聯絡通道，下行月台與[[檢票口]]間的高低差大約70公尺<ref>[https://www.ettoday.net/dalemon/post/30791 實拍日本最恐怖車站，往下陰溼「462階階梯」到不了月台]，ETtoday新聞雲，2017Oct18</ref><ref>[https://www.kiri-san.com/post/20665 日本第一深入地底恐怖車站【群馬県みなかみ町土合駅】鐵道宅的朝聖地]， 2018 KIRI-SAN.COM</ref>。因此，本站又被稱為「日本第一的地下車站」。在日本發行的[[公共交通时刻表|列車時刻表]]中，會在「[[高崎線]]·上越線·[[信越本線]]下行」頁面旁標註「從土合站的檢票口到下行月台需要大約10分鐘」，而在[[有人車站]]時代更是會在發車前10分鐘就停止檢票<ref>[https://www.sankei.com/west/news/180629/wst1806290003-n1.html 欄外は情報の宝庫　謎の「ご注意」が上越線ページに]，[[產經新聞]]，2018/08/17}</ref>。另外，在站內的樓梯上還設置有可供乘客休憩的[[ 長椅]]<ref name=navi/> 。