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其中最為人所熟知之事蹟是2001年1月回到新日本後，參加「巨人馬場三回忌追悼興行」比賽。在比賽中首次使出了自創的知名必殺技「閃光魔術」。後來不但在日本流行，在美國等地也十分風行，許多職業摔角選手除學習他的招式外並發展出各種變化。在這一年，武藤再度創造另一個高峰，首度跨聯盟挑戰全日本「三冠重量級王座」及「世界雙打王座」，以及新日本「IWGP重量級雙打」腰帶，是日本摔角史上首次跨聯盟集六條腰帶於一身的選手，並在12月贏得全日本聯盟的「世界最強雙打系列賽」冠軍，稱之為「史上第一七冠王」，因此三度獲選為日本職業摔角大賞的『年度MVP』。

==視頻==

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*1988年7月27日回到日本，在成田機場與同樣由海外歸國的蝶野正洋與橋本真也會合，新日本公司舉辦盛大記者會，並宣布組合三人為「鬪魂三勇士」，並立刻於7月29日舉辦「鬪魂三勇士出道戰」。「鬪魂三勇士出道戰」後，武藤再度前往美國德州，參加WCWA比賽，後來被WCW挖角。

*1989年1月以反派角色「花面大帝」的兒子Great Muta的角色參賽，開始受到矚目，在美國職業摔角界也成為知名人物。

==巔峰時代==

*1990年於日本與蝶野正洋搭檔，擊敗馬沙齊藤與橋本真也取得第12屆IWGP雙打王座。後來武藤即一直以本名比賽；因造型獨特白色T恤、橘色緊身褲、橘色護膝、白色鞋，在當時日本摔角界是一大創舉，由於戰績輝煌，受到摔角迷的喜愛，且希望他能使用Muta的角色出賽。

*1999年1月4日新日本例行的東京巨蛋試合，在這天武藤打敗同為nWo隊員的史考特·諾頓二度取得IWGP冠軍頭銜。

*2000年6月受到WCW的邀請，以MUTA分身前往美國比賽，當年比賽完即返國，並參加12月「豬木祭」大賽，並突然以光頭的造型登場造成話題，而光頭造型也一直持續到現在。

==史上第一位六冠王==

*2001年1月回到新日本，參加「巨人馬場三回忌追悼興行」比賽。在比賽中首次使出了自創的知名必殺技「閃光魔術」。後來不但在日本流行，在美國等地也十分風行，許多職業摔角選手除學習他的招式外並發展出各種變化。在這一年，武藤再度創造另一個高峰，首度跨聯盟挑戰全日本「三冠重量級王座」及「世界雙打王座」，以及新日本「IWGP重量級雙打」腰帶，是日本摔角史上首次跨聯盟集六條腰帶於一身的選手，並在12月贏得全日本聯盟的「世界最強雙打系列賽」冠軍，稱之為「史上第一七冠王」，因此三度獲選為日本職業摔角大賞的『年度MVP』。

*2010年4月5日，由於膝傷的手術，武藤全日本入團後，首次進行長期的休養，9月重返擂台，並於20日發表減重計畫挑戰『世界次重量級』的頭銜，最後在1個月內達成了減重10公斤的目標，進行了次重量級的頭銜賽。

*2011年6月7日，發生選手平井伸和遭毆的負面事件，武藤因此辭去社長一職，以選手身分活躍於擂台，8月27日在震災慈善的All Together大會中，與鐵人小橋建太組成雙打，這場比賽也獲選日本職業摔角大賞的『年度最佳比賽』。

==成立WRESTLE-1==

*2012年11月面對債務危機，武藤敬司出售全日本的股份並由SP社經營，武藤敬司續任董事會主席。