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先后有2名专家享受国务院政府特殊津贴，3人被确定为甘肃省优秀专家，3人被确定为甘肃省跨世纪学术技术带头人，6人被确定为市级跨世纪学术技术专业技术拔尖人才；5名专家型学者在全国、全省学术组织中担任学术职务；有10名科技人员获得或攻读硕士、博士学位 <ref>[https://www.sohu.com/a/295818368_120070933 如何申请博士学位？]，搜狐，2019-02-20</ref> 。现有科研试验基地4处，试验面积1400 hm2，其中科技部全国野外科学试验站、国家林业局祁连山水源涵养林综合试验区1229 hm2，部省合建林木良种繁育基地100 hm2，其它试验用地60余hm2，2003年将张掖市场中心苗圃兼并，面积87 hm2。现已建成了1000 m2的UNDP项目甘肃子项目培训中心。20余年来，先后在祁连山水源涵养林区寺大隆核心区、西水试验区以及龙渠种子园等浅山区建立气象观测站6座，地表径流观测场12个，量水堰2个，建有国内最高的全自动化林内小气候观测塔1座。标本室现存祁连山高等植物84科339属1044种共8000份，图书室藏书1.4万余册，档案资料室现存，科技档案370余卷。目前，以森林气象、森林土壤、森林水文为主的祁连山森林生态系统定位研究体系已初具规模形成网络。20余年来，共承担部、省、地及UNDP外援科研项目（课题）46项，取得科研成果42项，先后获部、省科技进步二、三等奖22项，地厅科技进步一等奖12项，推广奖1项，全省名优特林果产品银奖1项，出版专着5部，发表学术论文200余篇，部分研究成果被国内外学术界和农林大专院校教材引用，目前，以森林气象、森林土壤、森林水文为主的祁连山森林生态系统定位研究体系已初具规模形成网络。

经费投入：甘肃省祁连山水源涵养林研究院是国家林业局确定的第一批全国10个“森林生态系统定位研究站”和科技部首批进入全国“国家重点野外试验台站”的25个野外科学试验站之一，每年都有固定的建站经费支持，同时又是张掖市财政全额供给事业单位 <ref>[https://www.sohu.com/a/404235287_120643396 什么是事业单位？事业单位主要包括哪些单位？]，搜狐，2020-06-26 </ref> 。