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==机构简介==
截至2020年，研究所现有职工207人，其中，专业技术人员157人，具有正高级职称53人，副高级职称75人，博士生导 师34 师<ref>[https://www.sohu.com/a/423029421_115239 博士生导师有了明确选聘标准]，搜狐，2020-10-07</ref>34 人，硕士生导师69人；累计享受政府特殊津贴69人；现有工程院院士1人，国家级高层级人才5人，国家自然科学基金杰青获得者1人，优青获得者4人，人才工程国家级人选5人，中青年科技创新领军人才3人，农业科研杰出人才5人，现代农业产业技术体系首席科学家2人，重点研发项目首席科学家11人。
研究所现有管理服务部门7个，分别是办公室（人事处）、党委办公室、科研处、财务处、成果转化处、后勤服务中心、国家薯类作物研究中心综合办公室。从事科研工作的研究室10个，分别是种质资源研究室、十字花科蔬菜遗传育种研究室、茄科蔬菜遗传育种研究室、葫芦科蔬菜遗传育种研究室、栽培与采后技术研究室、植物保护研究室、生物技术研究室、花卉遗传育种与栽培研究室、马铃薯遗传育种与栽培研究室、质量安全与检测技术研究室。设有科技支撑部门1个，期刊编辑研究室。此外，研究所还是中国园艺学会的挂靠单位。
研究所相继建有作物细胞育种国家工程实验室、国家昌平综合农业工程技术研究中心2个国家级科研平台；国家蔬菜种质资源中期库、国家蔬菜改良中心、国家花卉改良中心、国家蔬菜科技创新联盟、农业农村部蔬菜品质监督检验测试中心、农业农村部植物新品种测试（北京）分中心等省部级平台13个；中国农业科学院分子育种平台、中国农业科学院代谢组学平台等院级平台7个；中-荷蔬菜遗传育种联合实验室（北京）、中-俄蔬菜种质资源挖掘利用联合实验室、中-捷菌根与环境生物技术研究中心等国际联合实验室及研发中心共5个。
建所以来，主持获得国家发明一等奖、科技进步一等奖、自然科学奖二等奖等国家级奖励21项，省部级奖励68项。建成了保存量世界第四的蔬菜种质资源库；育成审定、登记或获得植物新品种保护权的蔬菜花卉品 种700 种<ref>[https://roll.sohu.com/a/639763268_236074 干货丨80余种园林春播花卉品种推荐] ，搜狐，2023-02-12</ref>700 多个；创新并推广了地膜覆盖、韭蛆绿色防控等重大技术并大面积推广应用；近十年来，累计在Nature、Science、Cell等顶级期刊发表SCI论文54篇，应用基础领域实现了研究跟跑-并跑-领跑的跨越。这些成果的应用有力支撑了我国蔬菜花卉产业健康持续发展。
下一步，研究所将按照习近平总书记“四个面向”“两个一流”的要求，针对蔬菜花卉产业需求和学科发展需要，一是面向世界蔬菜花卉科技前沿，积极申报国家重点实验室等国家战略科研平台，重点在种质资源、高效栽培技术、病虫害绿色防控、采后加工与质量安全等领域创新和储备一批公共性、前瞻性基础理论和方法。二是面向国家重大需求，加强科技创新，重点解决高端优质品种资源匮乏、绿色安全生产等“卡脖子”问题；加大产业走出去力度，进一步提升国际竞争力；打造蔬菜花卉研究领域国家战略科技力量。三是面向现代农业建设主战场，建立新型研发机构，促进科企融合发展，加大新品种、新技术推广力度，助推供给侧结构性改革，发展蔬菜花卉产业，推进乡村振兴，加快农业农村现代化建设。四是面向人民生命健康，保障蔬菜花卉产品质量安全，确保农民用上绿色环保技术，生产优质、安全的蔬菜花卉产品。