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'''中国科学院系统科学研究所'''1979年10月成立。中国著名科学家关肇直院士、吴文俊院士、许国志院士是主要创始人。关肇直院士是首任所长。继任所长成平研究员和陈翰馥院士、郭雷院士，2008年所长高小山研究员 <ref>[https://www.sohu.com/a/484197665_121117786 评研究员条件是什么？有哪些要求？] ，搜狐，2021-08-19 </ref> ，副所长张纪峰研究员，所长助理杨晓光研究员。系统科学研究所以多学科交叉为特点，在系统控制、数学机械化、系统运筹与管理、统计与科学计算、复杂系统以及某些近代数学分支等多个学科领域的研究具有鲜明的特色和突出的优势。

1998年12月系统科学所与其他三个数学类研究所(数学所、应用数学所、计算数学与科学工程计算研究所)整合组建了数学与系统科学研究院，并进入了中国科学院知识创新工程。系统科学所逐渐成为单纯的学术组织、管理和交流的机构。系统科学所整体实力雄厚，53名科研人员中，研究员31人，中国科学院院士5人、中国工程院院士 1人、博士生导 师30 师<ref>[https://www.sohu.com/a/423029421_115239 博士生导师有了明确选聘标准]，搜狐，2020-10-07</ref>30 人。所内25名45岁以下年轻高级研究人员中，5人获国家杰出青年科学基金，3人获中科院百人计划支持，连续四届4人获中国科学院青年科学家奖(三届一等奖)及多种荣誉。