[[File:波札那NO AIDS.jpeg|thumb|200px|右|[https://www.bw.undp.org/content/dam/botswana/img/HIVAIDS/Botswana_HIV%20and%20AIDS%20HT.jpg/jcr:content/renditions/cq5dam.web.460.306.jpeg 原圖鍵連]]]波札那的愛滋病感染率位居全球前列，這導因於非洲的性觀念開放，加上愛滋病可透過母子垂直感染，但政府透過編列預算提供免費愛滋藥物、檢查愛滋病等方式，以遏止愛滋病罹患人口攀升。2001年至2011年間，艾滋病發病率下降了71％，相對的提高國民平均壽命。總統於國情咨文中提及，在實現零新感染的目標之前對抗艾滋病仍為首要事項。<ref name="CIA"/><ref>{{cite web| url=https://e-info.org.tw/node/27540 |title=擺脫亡國滅種厄運 波札那對抗愛滋病有成|date=2007-10-23| publisher=環境資訊中心| language = ZH |accessdate=2019-11-05}}</ref><ref>{{cite web| url=https://www.thenewslens.com/article/21646 |title=非洲總統「萬萬歲」：全世界前20名「長壽」元首，他們就囊括一半...|date=2015-08-16| publisher=關鍵評論網| language = ZH |accessdate=2019-11-05}}</ref><ref>{{cite web| url=https://www.bw.undp.org/content/botswana/en/home/ourwork/hiv_aids/overview.html|date=2018年 |title=HIV/AIDS | publisher=UNPD in Botswana | language = EN|accessdate=2019-11-06}}</ref> 

波札那在艾滋病的治療方面已取得重大進展，但在預防方面卻成效不彰，加上國際捐助資金的減少，預防艾滋病仍存有許多障礙。<ref name="CIA"/><ref>{{cite web| url=https://e-info.org.tw/node/27540 |title=擺脫亡國滅種厄運 波札那對抗愛滋病有成|date=2007-10-23| publisher=環境資訊中心| language = ZH |accessdate=2019-11-05}}</ref><ref>{{cite web| url=https://www.thenewslens.com/article/21646 |title=非洲總統「萬萬歲」：全世界前20名「長壽」元首，他們就囊括一半...|date=2015-08-16| publisher=關鍵評論網| language = ZH |accessdate=2019-11-05}}</ref><ref>{{cite web| url=https://www.bw.undp.org/content/botswana/en/home/ourwork/hiv_aids/overview.html|date=2018年 |title=HIV/AIDS | publisher=UNPD in Botswana | language = EN|accessdate=2019-11-06}}</ref><ref>{{cite web| url=https://www.avert.org/professionals/hiv-around-world/sub-saharan-africa/botswana|date=2018年 |title=HIV AND AIDS IN BOTSWANA | publisher=AVERT| language = EN|accessdate=2019-11-06}}</ref>