變更

東港溪主流上游為[[萬安溪]]，發源於屏東縣[[泰武鄉]]的[[日湯真山]]<ref name="臺灣大百科全書">[http://nrch.culture.tw/twpedia.aspx?id=1495 〈東港溪〉，《臺灣大百科全書》]</ref>。

從前東港溪的主流上游為水量豐沛的[[隘寮溪]]，其源頭位於[[遙拜山]]。1938年修築完成隘寮溪南岸長堤，導引溪水向西北流入[[荖濃溪]]；其後又興建一連串的堤防，以切斷隘寮溪南側各分流。從此隘寮溪變成荖濃溪的支流，東港溪遂改以[[萬安溪]]為主要的源流，其河長與流量均大幅減少<ref>楊萬全，高屏溪流域和屏東平原的水資源，台灣水文論文集，2000年5月，第562頁</ref>。

[[經濟部]][[水利署]]已將東港溪列為水質最差的河川之一，尤其是下游地段，水質惡臭且混濁。東港溪上游原有一處[[鱷魚]]養殖場，因為[[六一二水災]]的關係，導致養殖場的[[眼鏡凱門鱷]]被沖入東港溪，目前已在溪流中繁衍後代。據最近的捕捉紀錄顯示，河中最大的[[眼鏡凱門鱷]]約有1.5米以上。

自2010年開始,水利署於[[萬丹鄉]]興化村、[[竹田鄉]]鳳明村、[[崁頂鄉]]力社村交界一帶,同時也是[[麟洛溪]](亦稱隘寮溪)匯入點進行截彎取直的治水工程,原本的東港溪在流經興社大橋後,會轉向東流並畫出直徑約500~600公尺的半圓,再往西與麟洛溪交會。工程進行首先拆除連接興化與力社的興社大橋,再沿半圓直徑進行填土工程,將原本該向東彎曲的河道,改往西南流向,原本兩溪的交界點往北遷移200公尺,經此整治後,麟洛溪(主要為萬丹)及東港溪中上游的水患明顯改善。