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截至2012年，赤水市境内有高等植物2116种，其中 [[ 维管植 物1964 物]]1964 种，国家重点保护植物20种，特有植物27种，代表植物包括 [[ 小黄花茶 ]] 、 [[ 赤水蕈树 ]] 等。 国家一级保护植物、侏罗纪残遗种——“ 桫椤”在赤水生长十分密集，仅 [[ 赤水桫椤 ]][[ 国家级自然保护区 ]] 内就达4.7万株，是全世界分布最集中的区域<ref>[http://www.bytravel.cn/Landscape/12/wangguo.html 赤水桫椤国家自然保护区]，博雅旅游分享网</ref>。

截至2012年，赤水市有野生动物1668种，其中脊椎动物404种，昆虫1264种， [[ 云豹 ]] 、 [[ 长尾雉 ]] 、 [[ 苏门羚 ]] 等国家重点保护动物39种，长江上游特有鱼类25种。

赤水具有亚热带生物生存和活动的条件，其森林植被地带类型属贵州高原偏湿性常绿阔叶林地带的赤水河谷中山 [[ 樟栎林 ]] 、 [[ 松杉林 ]] 、 [[ 毛竹林 ]] 小区；植被类型分属中亚热带常 [[ 绿阔叶林 ]] 、 [[ 针阔叶林 ]] 混交林、 [[ 针叶林 ]] 和 [[ 竹林 ]] 四个群纲 。 截至2012年，赤水市森林覆盖率达76.17%,其中有我国罕见的中亚热带常绿阔叶原生林43万亩；有野生植物和野（脊椎）动物1000多种，其中有桫椤、小金花茶、赤水蕈树等重点保护珍稀植物23种，有云豹、长尾雉、苏门羚等重点保护珍稀动物22种。赤水市竹林面积114万亩，有各类竹36种。年产木材4万立方米，楠竹400万根，杂竹40万吨，竹笋3万吨。赤水物产以南亚热带的荔枝、龙眼、香蕉、柚子等水果为主要品种，中草药种类达300多个 。