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截至2013年8月，学校拥有11个自治区高等学校重点实验室（宇宙线研究所<ref>[http://www.ihep.cas.cn/kxcb/kpcg/lztt/kpyd_yzsx/kpyd_ihepyzx/200909/t20090914_2482174.html 高能所宇宙线研究的起源]，中国科学院高能物理研究所，2009-09-14</ref>、 [[ 青藏高原生物多样性 ]] 与分子进化研究实验中心、 [[ 藏药现代化研发 ]] 与藏药质量检测实验中心、土木工程实验中心、 [[ 自然语言处理实验室 ]] 、经济管理综合实验室等），1个教育部人文社会科学重点研究基地——西藏大学· [[ 四川大学 ]] 中国藏学研究所，1个教育部工程研究中心（藏文信息技术国家地方联合工程研究中心）——藏文信息技术研究中心，1个教育部重点实验室-—— [[ 羊八井 ]] 宇宙线开放实验室，1个中国科学院和自治区共建重点实验室—— [[ 那曲生态环境综合观测研究站 ]] 。

建有西藏大学可持续发展研究所、西藏大学 [[ 宇宙线研究所 ]] 、西藏大学中国 [[ 藏学研究所 ]] 、西藏大学艺术学院艺术研究所、西藏大学《格萨尔》研究所、西藏大学 [[ 人口研究所 ]] 、西藏大学 [[ 教育心理研究所 ]] 、西藏大学环境物理研究所、西藏大学 [[ 高山动物生态研究所 ]] 、西藏大学西藏经济研究所、西藏大学数学教育研究所等研究所。

2009-2013年8月，学校先后承担省部级以上科研项目477项，其中科技部“973”项目1项，“973”前期研究专项3项，科技部 [[ 创新基金项 目1 目]]1 项，国家 [[ 火炬计划项 目1 目]]1 项，国家 [[ 软科学项 目1 目]]1 项，科技部国际合作项目1项，国家 [[ 自然基金重点项 目1 目]]1 项，科研经费达10733.1万元。

获得省部级科研成果奖20项，中国藏学研究珠峰奖4项，“藏文软件研发与推广应用”成果获得2011年度国家科学技术进步二等奖，自治区科技进步奖10项。获得专利13项，其中发明专利3项。“ [[ 藏族唐卡勉唐派 ]] ”、“藏族唐卡钦泽派”和“藏族矿植物颜料制作技艺”分别列入第一批、第三批国家级非物质文化遗产名录<ref>[http://www.ihchina.cn/Article/Index/detail?id=14718 藏族矿植物颜料制作技艺]，中国非物质文化遗产网</ref>。

2006-2010 年——2010 年，全校发表各类学术论文1175篇，其中被EI收录4篇，SCI收录12篇。出版专著、译著（教材）45部。