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真核生物
,→2005年国际原生生物学家协会分类
|-
| [[泛植物界|泛植物界 (Archaeplastida)]] || [[陆生植物]]、[[绿藻]]、[[红藻]]、[[灰胞藻门|灰胞藻]]
|}<ref>[http://blog.sciencenet.cn/blog-62701-866292.html 真核生物主要类群演化树],科学网, 2015-2-7 10:46 </ref>
但是,这一"六界说"很快就遭到了新的研究的挑战,特别是对[[囊泡藻界]]是否有共同起源的质疑。真核生物的分类目前仍有很大的不确定性。例如,把真核生物分为[[单鞭毛生物]](Unikonta)与[[双鞭毛生物]](Bikonta),前者包括[[变形虫界]]与[[后鞭毛生物]],后者其它四界。但是,很多研究表明单鞭毛生物与双鞭毛生物都不是同源的进化支。另外,[[有孔虫界]]应该并入[[囊泡藻界]]。[[泛植物界]]也应该不是同源的,需要被细分。