1960年联合国教科文组织发起了“努比亚行动计划”，自1972年起，埃及政府在联合国教科文组织的协助下，在神庙周围修建围堰，将堰中河水抽干。然后逐渐将神庙拆卸分解后搬迁到距原址500多米的阿吉勒基亚岛上，按照原样重建。1980年3月，搬迁重建工作全部完成，神庙重新开放。
菲莱神庙在1979年被联合国教科文组织评定为世界文化遗产 <ref>[http://www.shijiebang.com/u290581/poa-400365/ 阿斯旺菲莱神庙-精美的浮雕壁画带你走入神话世界]，世界邦</ref> 。
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