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该中心依托中国科学院北京基因组研究所，联合中国科学院上海营养与健康研究所和中国科学院生物物理研究所共同建设，上级主管部门为科技部基础司和中国科学院。中心设立管理委员会 <ref>[http://www.doc88.com/p-1982503331606.html 委员会组织机构及职责]，道客巴巴，2018-07-19</ref> 、专家委员会和用户委员会，建立中心运行管理机制，实行主任负责制，全面负责运行和管理工作。中心组建70人左右的科学数据专业化团队，提供基因组学数据统一存储、整合挖掘、共享应用的一站式数据服务，成为有国际影响力的基因组科学数据中心。

多组学生物大数据<ref>[https://www.sohu.com/a/235315664_100065429 什么是大数据，一张图带你看懂大数据] ，搜狐，2018-06-12</ref>