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何曉青
北京林業大學

何曉青，女，北京林業大學副教授。

人物簡歷

995-1999 華中農業大學 學士

1999-2002 華中農業大學 碩士

2004-2007 中國科學院生態環境研究中心 博士

2002-今 北京林業大學 任職

2011.5-2012.5 瑞士聯邦水科學與技術研究所（EAWAG） 訪問學者（博士後）

2013.7-2013.8 美國密歇根州立大學 訪問學者

研究領域

植物-微生物組互作機制（微生物如何影響宿主健康） 結合網絡作圖（network mapping）等關聯分析方法，全基因組角度挖掘塑造植物微生物組的植物樞紐基因, 篩選關鍵微生物類群並解析微生物組對表型形成的貢獻，量化植物-微生物組的相互影響，探究植物與微生物組互作調控機制, 系統地研究微生物組在植物抗病、營養吸收、生長發育等過程中的功能和分子機理。

生態系統中微生物群落構建機制（微生物如何維持生態功能） 建立了研究不同生態系統（林地、草地、農田、水體等）中微生物群落構建機制的方法體系（微生物結構及多樣性、共發生網絡模式、群落組裝機制、功能潛力等）。已揭示了濕地生態系統中稀有類群和豐富類群的多樣性分布模式和群落組裝機制，研究結果有助於推動對稀有和豐富類群組裝機制的認識，為濕地系統水資源利用和淨化提供了科學依據。

微生物水體修復 並針對水體常見問題（黑臭、水華、青苔），利用微生物對水體的淨化作用，研發了系列淨水製劑。在污染水體中使用特定的微生物菌劑，配合生態工法設計和水生植物栽植,形成以微生物菌劑為核心的水下生態修復及水體生態系統構建技術。操作簡單，成本低廉，效果明顯，配合水生植物栽植，模擬自然的駁岸，既能保證水體水質，也能營造良好的景觀效果。

承擔項目

  • 全基因組系統作圖（systems mapping）研究三種細菌種間互作遺傳機制，國家自然科學基金面上項目，68.6 萬元，主持，2020.1.1-2023.12.31。
  • 再生水補給河道微生物功能特徵研究，橫向課題，14.5萬，2022.04.25-2022.12.31
  • 喀斯特地區石漠化綜合治理技術集成與應用，中國科學院科技服務網絡計劃（STS計劃）子課題，10 萬元，主持，2018.1.1-2019.6.30。
  • 典型城市飲用水體系中輪狀病毒的分布與健康風險，國家自然科學基金青年項目，25 萬元，主持，2012.1.1-2014.12.31。
  • 重點流域典型水源地風險污染物篩查和評價，水利部公益性行業專項經費項目，64 萬元，子課題負責人，2012.1.1-2014.6.30。
  • 水環境監測的新技術、新方法研發與應用示範，國家水體污染控制與治理科技重大專項，25 萬元，專題負責人，2010.1.1-2012. 12.31。
  • 參加國家自然科學基金項目-基於植物和微生物篩選的人工景觀水體自淨技術與應用 2018-2020
  • 參加北京林業大學科技創新計劃-冬眠中達烏爾黃鼠腸道微生物調控能量代謝研究 2018-2019
  • 參加北京林業大學青年教師科學研究中長期項目-森林生物資源利用—森林食品資源開發與綜合利用 2015-2020
  • 參加北京林業大學基礎科學研究團隊專項計劃-森林資源與環境微生物的應用基礎研究 2012-2016

學術成果

論文

  • Yan Yang, Kexin Cheng, Kaihang Li, Yi Jin, Xiaoqing He*. Deciphering the diversity patterns and community assembly of rare and abundant bacterial communities in a wetland system. Science of The Total Environment. Online, 2022（二區，IF：10.753）
  • Xiaoqing HE , Qi ZHANG , Beibei LI , Dr Yi JIN , Libo JIANG, Rongling WU. Network mapping of root-microbe interactions in Arabidopsis thaliana. npj biofilms and microbiomes, 2021, 7,72.（二區，IF：8.462）
  • Dengcheng Yang, Xuyang Zheng, Jiang Libo, Ye Meixia, Xiaoqing He, Yi Jin, Rongling Wu. Functional mapping of phenotypic plasticity of Staphylococcus aureus under vancomycin pressure. Frontier in microbiology, 2021,12:696730. （二區，IF：5.64）)
  • Yang, D., Jin, Y., He, X. et al. Inferring multilayer interactome networks shaping phenotypic plasticity and evolution. Nature communications 2021, 12, 5304. （一區，IF：17.694）
  • Qi Zhang, Yajing Liang, Weiwen Kong, Dongyang Wang, Yi Jin, Yu Ye, Xiaoqing He*, Libo Jiang*. Transcriptional differentiation driving Cucumis sativus–Botrytis cinerea interactions based on the Skellam model and Bayesian networks. AMB Express, 2021,11, 138 . (IF= 4.126）
  • Yajing Liang, Beibei Li, Qi Zhang, Shilong Zhang, Xiaoqing He*, Libo Jiang,Yi Jin. Interaction analyses based on growth parameters of GWAS between Escherichia coli and Staphylococcus aureus. AMB Express,2021, 11, 34 (IF= 4.126).
  • Zheng Xuyang, Bai Jun,Ye Meixia, Liu Yanxi, Jin Yi, He Xiaoqing*. Bivariate genome-wide association study of the growth plasticity of Staphylococcus aureus in coculture with Escherichia coli. Applied Microbiology and Biotechnology ,2020，104, 5437–5447. (二區，IF=4.813）
  • Mengdi Rong, Xuyang Zheng, Meixia Ye, Jun Bai, Xiangming Xie, Yi Jin，Xiaoqing He*. Phenotypic Plasticity of Staphylococcus aureus in Liquid Medium Containing Vancomycin. Frontier in microbiology, 2019,10:809.（二區，IF=4.259）
  • Libo Jiang#, Xiaoqing He#, Yi Jin#, Meixia Ye#, Rongling Wu. A competition-cooperation mapping framework of community dynamics. Nature communications, 2018, 9: 3010.( 一區，IF=12.124)
  • Xiaoqing He#, Yi Jin#, Meixia Ye#, Nan Chen, Jing Zhu, Jingqi Wang, Libo Jiang, Rongling Wu*. Bacterial genetic architecture of ecological interactions in co-culture by GWAS-Taking Escherichia coli and Staphylococcus aureus as an example. Frontier in microbiology, 2017, 8 :2332.（二區，IF=4.08）
  • YubingWang, XiaoliLi, LiboJiang, WentaoHan, XiangmingXie, YiJin*, Xiaoqing He* and RonglingWu*. Novel Mutation Sites in the Development of Vancomycin- Intermediate Resistance in Staphylococcus aureus. Frontier in microbiology, 2017, 7 :2163.（二區，IF=4.08）
  • Tingting Liu,Weiwen Kong,Nan Chen,Jing Zhu. Jingqi Wang,Xiaoqing He*. Bacterial characterization of Beijing drinking water by flow cytometry and MiSeq sequencing of the 16S rRNA gene. Ecology and Evolution, 2016, 6(4):923-934. (IF=2.3).
  • Weiwen Kong, Nan Chen, Tingting Liu, Jing Zhu, Jingqi Wang, Xiaoqing He*, Yi Jin. Large-scale transcriptome analysis of cucumber and Botrytis cinerea during infection. PLOS One, 2015, 10(11): e0142221. (IF=3.2).
  • Xiaolu Liu, Jingqi Wang, Tingting Liu, Weiwen Kong, Xiaoqing He*. Effects of assimilable organic carbon and free chlorine on bacterial growth in drinking water. PLOS One, 2015, 10(6): e0128825. (IF=3.2).
  • Yu-Mei Wei, Jing-Qi Wang, Ting-Ting Liu, Wei-Wen Kong, Nan Chen, Xiao-Qing He*, Yi Jin. Bacterial communities of Beijing surface waters as revealed by 454 pyrosequencing of the 16S rRNA gene. Environmental Science and Pollution Research, 2015, 22(16):12605-14. (IF=2.8).
  • Boyun Yang, Xiaoqing He* et al. Rapid and sensitive detection of human astrovirus in water samples by loop-mediated isothermal amplification with hydroxynaphthol blue dye. BMC microbiology, 2014, 14(8) (IF=3.1).
  • Xiaoqing He; Li Cheng; Deyou Zhang. Molecular detection of three gastroenteritis viruses in urban surface waters in Beijing and correlation with levels of fecal indicator bacteria. Environmental Monitoring and Assessment,2012,184(9): 5563-5570( IF=1.6).
  • Xiaoqing He; Li Cheng; Deyou Zhang; Xiangming Xie; Donghong Wang; Zijian Wang. One-year Monthly Survey of Rotavirus, Astrovirus and Norovirus in Three Sewage Treatment Plants (STPs) in Beijing, China and Associated Health Risk Assessment. Water Science and Technology. 2011,63（1）,191-198. (IF=1.1).
  • He XQ, Cheng L, Li W, Xie XM, Ma M, Wang ZJ. Detection and distribution of rotavirus in municipal sewage treatment plants (STPs) and surface water in Beijing. Journal of Environmental Science and Health, Part A.2008, 43（4）：424-429. (IF=1.3).
  • He XQ, Cheng L, Zhang DY, Li W, Xie XM, Ma M, Wang ZJ. First Molecular Detection of Group A Rotaviruses in Drinking Water Sources in Beijing，China. Bulletin of Environmental Contamination and Toxicology, 2009, (83):120–124. (IF=1.1).
  • Mingjia Yang, Xiangming Xie, Caixia Zheng,Fangqiu Zhang,Xiaoqing He,Zhiru Li. Agrobacterium tumefaciens-mediated genetic transformation of Acacia crassicarpa via organogenesis. Plant Cell, Tissue & Organ Culture, 2008, (95): 141-147. ( IF=1.3).
  • Mingjia Yang, Xiangming Xie, Xiaoqing He, Fangqiu Zhang. Plant regeneration from phyllode explants of Acacia crassicarpa via organogenesis. Plant Cell, Tissue & Organ Culture, 2006(85): 241-245 . (IF=1.3).
  • 楊艷,王浩,李凱航,李貝貝,張琦,金一,何曉青* 長江三峽上游水域細菌群落結構與功能預測. 2022, 62(4): 1401-1415.
  • 李貝貝, 朱晗釗, 張琦, 楊鵬, 金一, 何曉青* 影響微生物互作的重要基因研究進展：以大腸桿菌為例. 微生物通報，2021, 48(9): 3071-3082.
  • 張琦，梁雅靜，張宇馨，陳玲慧，韓鍾嬈，李貝貝，金一，何曉青*. 基因編輯技術對大腸桿菌yjjW 基因點突變的兩步法策略2021, 61(1):183-194
  • 梁雅靜，何曉青*、金一、姜立波，葉梅霞，鄔榮領. 二代測序技術（NGS）結合遺傳統計模型在微生物分子生態學中的研究進展. 中國科學：生命科學. 2020,2:217-214.
  • 張佐然，李金婷，梁雅靜，張琦，金一，何曉青*. 利用系統作圖(Systems mapping)研究大腸埃希菌和金黃色葡萄球菌的互作遺傳機制. 微生物學通報 2019,46(2):292-300
  • 朱璟, 王崢鑒， 張佐然, 李金婷, 梁雅靜, 金一, 何曉青*. 不同培養條件下金黃色葡萄球菌表型可塑性研究. 微生物學雜誌，2019，39(4):10-16.
  • 陳南，朱璟，葉梅霞，金一，何曉青*，鄔榮領. GWAS研究大腸桿菌和金黃色葡萄球菌種間互作進化機制.微生物學報. 2017，57(4): 526-538.
  • 劉婷婷，孔維文，王敬琦，何曉青*. 基於流式細胞術研究管網水中細菌的穩定性.應用與環境生物學報,2016, 22（1）：1136-1142.
  • 王敬琦，孔維文，劉婷婷，陳南，楊柏雲，何曉青*.基於esp基因和JCV標記的MST方法在五大流域典型水源地中的應用.生態毒理學報, 2015,10(6):246-252.
  • 劉曉露，王敬琦，張柏林，何曉青*. 可同化有機碳和余氯對飲用水中細菌活性的共同影響.安全與環境學報.2014, 14(3):198-201.
  • 楊柏雲,韋玉梅，何曉青*等. 基於LAMP的人輪狀病毒檢測方法及其在水環境中的應用.安全與環境學報.2013,13（1）:113-118.
  • 楊麗,程莉，何曉青*等. 環介導等溫擴增技術(LAMP)檢測人星狀病毒方法的建立及其在再生水檢測中的應用.生態毒理學報, 2011, 6:595-602.[1]

參考資料

  1. ↑ 北京林業大學
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