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性器官又叫生殖器，是生物體產生生殖細胞用來繁殖後代的器官。高等植物的生殖器是花（包括雄蕊和雌蕊）。人和高等動物的生殖器包括雄性的精囊，輸精管，睾丸，陰莖等；男性生殖系統由內、外生殖器2個部分組成。外生殖器包括陰囊和陰莖；內生殖器包括生殖腺體(睾丸)、排精管道(附睾、輸精管、射精管和尿道)以及附屬腺體(精囊腺、前列腺和尿道球腺);雌性的卵巢，輸卵管，子宮，陰道等。人和高等動物的性器官是發生性行為的必要條件。[1]
植物方面
孢子植物孢子體的雌性生殖器官為頸卵器，雄性生殖器官為精子器。種子植物的花、果實或種子。雄性生殖器官為雄蕊，雌性生殖器官為雌蕊。
但植物的繁殖不一定依賴這些器官或組織。[2]
發育
雌雄兩性的生殖器官是來自同一組來源。
在受孕幾周後，雌雄兩性的胚胎其生殖器官在解剖學上都一樣（雖然其性染色體不同），基本上類似雌性的生殖器官，擁有一對「泌尿生殖皺摺」，中間有一小隆起物，隆起物後有尿道。另外還有一對生殖腺位於體內。
在一般人類胚胎的發育過程中，（位於雄性染色體的）SRY基因會使生殖腺發育為睾丸，沒有SRY基因生殖腺則會發育為卵巢。在此之後，內生殖器與外生殖器的發育是由某些胚胎生殖腺分泌的荷爾蒙決定。如果生殖腺發育為睾丸，而睾丸分泌睾脂酮，而且細胞也對睾脂酮有反應，則外側皺摺會腫起，中線會融合以形成陰囊。隆起物會長大變直形成陰莖，皺摺內側會包住陰莖，中線會融合以形成陰莖尿道。出生後睾丸會下降入陰囊。如果生殖腺發育為卵巢，另外一套過程會形成雌性內外生殖器。
以上一般過程中出現特殊變化，就會形成程度不一的雌雄同體現象。
之後在青春期，生殖器官還會有規模較小的發育。