八堵以下則向西南流，經汐止市、南港而進入台北盆地，其河道蜿蜒曲折，形成一條東窄西寬的河谷沖積扇。基隆河自南港以下進入台北市，並在關渡匯入淡水河。基隆河進入[[台北盆地]]之後，基隆河河道在氾濫平原上自由擺動，擺動幅度很大，因此曲流地形十分發達，也因曲流擺盪幅度大，使得主河道排洪速度減緩，兩岸容易在大雨時發生水患，且基隆河下游段又是一感潮河段，滿潮時河水上溯可至汐止(昔稱水返腳)。風災引起的暴潮經常影響到基隆河下游的排洪，民國85年截彎取直工程完工及民國90年 [[ 納莉 颱 風 災 ]] 過後築起的堤防，雖已減少水患，但是也大大改變基隆河原來的形貌 。