2008年7月4日，两岸定期航线开始营运，华航CI-7957航班成为第一个启航的国籍航空班机。2009年，华航为庆祝创立50周年，在旗下机队涂上50周年纪念彩绘。同年3月18日，华航再度通过国际航协飞航[[安全]]查核认证，此为中华航空第三度通过国际航协的飞航安全查核认证。