另外，[[台北捷运南港线]]施工时，由於台北车站～西门站间路线将自北门下方穿越，因此当时也受到不少注目。除了进行建物监测及潜盾隧道施作工法的修正外，并於城门的圆拱门洞及台座架设大型支撑系统（1996年拆除）。