艮山门站原货运业务包括办理整车货物发到、整车货物承运前保管业务；整零货物发到业务，不办理危险货物发到业务。为应对杭黄高速铁路、商合杭高速铁路开通而产生新的动车组列车车底的存放、维护和检修问题，艮山门站货场将被改造为杭州动车运用所的一部分，原有货运业务将转移至杭州北站和萧山站办理。2016年7月底开始转场工作：7月27日开始，艮山门站除行包班列及市金专用线外到达外，其它零星到达的货物不再办理接卸，原到达艮山门的卸车均在杭州北站新货场办理；8月1日晚上6点半，车站迎来了最后一班到达的货运列车；晚上10点，开往乔司站的48718次列车发车，艮山门的货运业务自此停止办理。但由于货场内设备转移的关系，8月2日仍有发往杭州北站的小运转列车。

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