新站站體主要為鋼骨結構的2面4線[[島式月台]][[地面車站]]，車站設計由曾經手[[新國立競技場]]及[[澀谷站]]的建築師[[隈研吾]]操刀>，面积4000平方米。站体外觀以折紙作為構想，凸显日本传统建筑风格；屋顶由玻璃、木材和钢材组成，从上空俯瞰车站可依稀透过玻璃看见站体内部。此外屋顶覆盖的膜涂层具有调节站内采光的温度的功能，加上在屋顶铺设发电用[[光伏模組|太阳能电板]]和小型[[风力发电机]]，可有效降低车站能耗<ref >[https://www.jreast.co.jp/e/press/2019/pdf/20191204.pdf Takanawa Gateway Station Overview: Trial deployment of new station service equipment and the creation of never-before-seen station stores]，JR东日本，2020-03-14</ref>；站 体东 體東 西立面 为 為 玻璃幕墙， 并 並 由木制支架支撑<ref>{{cite journal|title=隈研吾设计山手线新车站|work=广西城镇建设|year=2016|volume=10}}</ref> 。

車站燈光設計則由建築照明設計師[[面出薰]]主理<ref><ref>[https://trafficnews.jp/post/82261 山手線の新駅「高輪ゲートウェイ」に名称決定]，JR東日本，2018-12-04</ref>，部分橫梁與天花板采用來自[[岩手縣]]、[[宮城縣]]及[[福島縣]]產的[[杉木]]<ref>[https://www.msn.com/zh-tw/news/world/%E6%97%A5%E5%B1%B1%E6%89%8B%E7%B7%9A%E6%96%B0%E7%AB%99%E4%BA%AE%E7%9B%B8-%E6%8E%A1%E5%85%89%E4%BD%B3%E7%A9%BF%E5%A0%82%E5%AF%AC%E5%8F%AF%E8%81%9E%E5%88%B0%E6%9D%89%E6%9C%A8%E9%A6%99/ar-BBWPHWD 日山手線新站亮相 採光佳穿堂寬可聞到杉木]，中央社msn新闻，2019-11-16</ref> 。月台照明選用了[[松下]]的由PLC自動調光調色的系統，白天是白色，傍晚開始是燈泡色<ref>[https://news.panasonic.com/jp/press/data/2020/03/jn200304-2/jn200304-2.pdf PLC（電力線通信）による駅ホーム用の照明制御システムをJR東日本と共同研究開発 〜2020年3月14日開業予定の高輪ゲートウェイ駅に納入〜]，Panasonic，2020-03-04</ref>。