:副總統吳敦義表示是誤會，他稱自從那個事件之後知道領事局有此服務的人就增加五倍，所以證明不是特權，從民國99年、100年、101年都有辦，當時他女兒帶兒子參加一個團，也依照這個規定，所以不是特權<ref>{{cite news|author=張正昌、林宏宇|title=吳敦義女另類宣傳？機場辦護照非特權 急件一年增五倍|url=http://www.setn.com/News.aspx?PageGroupID=6&NewsID=40957|newspaper=三立新聞網|date=2014-09-24}}</ref>。2015年2月25日，自由時報亦稱吳敦義女兒「意外宣導」急辦護照業務，使用這項業務的民眾也大幅增加，從99年領務局統計桃機辦事處共核發護照56件，100年為89件，101年為133件，102年8月經媒體報導後就大幅增加650件<ref>{{cite news|author=曹伯晏|title=吳敦義女兒「宣導」後 業務大增|url=http://news.ltn.com.tw/news/politics/paper/857850|newspaper=自由時報A5版|date=2015-02-25}}</ref>。
===壹週刊相關報導===
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|title = <span style="color: white;">壹週刊道歉與澄清刊登實錄</span>
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2014年1月15日第660期壹週刊針對吳敦義相關報導之道歉與澄清啟事，重點內容如下：<ref>{{cite news|title=壹週刊對四大不實報導道歉|url=http://www.taiwanenews.com/doc/20140115102|newspaper=台灣e新聞|date=2014-01-15}}</ref>
一、 本刊582期報導「吳敦義大樁腳拿[[陳啟祥]]1000萬」、「[[蔡令怡]]急電[[吳門忠]]探內情」。經查，吳門忠既非吳敦義大樁腳，蔡令怡也沒有急電吳門忠。
#101年7月10日週刊致電詢問有關「林益世與陳啟祥（及其岳丈）問題」時，吳副總統答覆並發布新聞稿指出：「我和內人並不認識陳啟祥先生，也不知道所稱『陳啟祥的岳丈』是誰？當然也沒有陳啟祥或『陳啟祥的岳丈』來請託過事情，所以我從未介入或聽聞陳啟祥與林益世之間的糾葛。」經林案一年多來的發展，證實吳副總統與該案無關，且最高法院檢察署特別偵查組於101年10月25日起訴林益世貪瀆案同時，已發布新聞稿指出：經該組檢察官調查結果，吳副總統確實未曾涉入任何林益世與陳啟祥間之事務。
#至於周刊報導內容提及「吳敦義大樁腳吳門忠」，吳門忠在接受媒體訪問時，曾多次強調他在90年、93年立委選舉時支持吳敦義，但「連一角都不曾捐給吳敦義過」，爾後儘管吳副總統在96年選舉順利連任立委、98年出任行政院長、乃至101年當選副總統，吳門忠也久未與吳敦義有過聯繫，僅在民國97年9月吳門忠嫁女兒時，連任立委的吳敦義應洪盛雄議員（吳門忠鄰居）代邀，前往致詞祝賀後，即趕赴其他喜宴。
二、第590期報導「吳敦義急撥公帑補助小姨子郝英蘭屠宰場獲一千五百萬」。經查，吳副總統妻妹郝英蘭的夫家並未經營屠宰場，本刊所稱「勝贏屠宰場」是她丈夫之父親的弟弟所生女兒林小姐所嫁丈夫朱家所經營，並無所謂「郝英蘭屠宰場」。「勝贏屠宰場」既非郝英蘭或其夫家所經營，且是在民進黨執政時期鼓勵設立家禽電宰場時，朱家申請並獲准設立，在劉內閣時期由農委會所補助多家屠宰場之一，其所獲補助並非最高，且與吳副總統完全無關。在行政院長任內，吳副總統從未會見過該電宰業者陳情代表，亦未曾指示農委會撥款補助。復查：在行政院長任內，吳副總統從未會見過該電宰業者陳情代表，亦未曾指示農委會撥款補助。
三、第599期「台北看守所地下所長設宴吳敦義私會[[竹聯幫]]大老」與事實有出入。所謂的竹聯幫大老既與吳副總統並不相識亦非當天餐敘廿餘位賓客之一，僅係在餐廳負責人陪同下，與三位香港及日籍客人一起進來房間向姚江臨等友人寒暄，並向出席餐會的吳副總統致意。
四、第572期「吳敦義主導夢想家決策」報導。經查，當時行政院長吳敦義僅聽取過文建會有關建國百年各項重大活動的方向和概要簡報，未曾聽或見過「夢想家」三個字及其內容，也從未介入該一節目的內容規劃、決策或執行。夢想家（建國百年國慶晚會音樂劇）相關活動內容、形式或發包等等，吳敦義院長從未干預。
副總統吳敦義1月15日聞訊後表示：真相大白，如釋重負，終於撥雲見日，是遲來的正義，對於週刊不實報導內容曾相當感慨，幾經函請該刊更正無效，不得已尋求法律途徑捍衛清白；強調他任公職三十餘年，一向秉持廉能勤政，歷任台北市議員、南投縣長、高雄市長、立法委員、行政院長及副總統，他帶領的政府團隊無論是他個人或行政院、部會首長、縣市政府局處首長，也從未有一人涉嫌貪瀆不法行為，足為明證；如今該刊對各期錯誤報導鄭重道歉暨全面更正澄清，新聞自由應當獲各界尊重，但深盼少數媒體報導能更加公正無私、審慎查證，恪守新聞自律與道德，才不會混淆視聽，顛倒黑白。<ref>{{cite news|author=陳弘修|title=壹週刊正式道歉澄清 吳敦義：真相大白如釋重負|url=http://www.ettoday.net/news/20140115/316360.htm|newspaper=東森新聞雲|date=2014-01-15}}</ref><ref>{{cite news|author=李明賢|title=壹週刊道歉，吳敦義：勿再陷害忠良|newspaper=中國時報|date=2014-01-16}}</ref>
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===出訪教廷誤領聖體===