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核蛋白结合蛋白质中的一类。普遍存在于各种生物的细胞核中的特殊形态的蛋白质，由核酸与组蛋白、精蛋白等的碱性蛋白结合而成为细胞核的主要成分。根据核酸种类不同，可分为核糖核酸核蛋白和脱氧核糖核酸核蛋白。可从细胞核中提取得到，能溶解于1mol/L NaCl溶液中。核蛋白中的蛋白质包括组蛋白(或精蛋白)和非组蛋白蛋白质。组蛋白含碱性氨基酸如精氨酸、赖氨酸等丰富的碱性蛋白，带正电荷。精蛋白仅出现于真核细胞中，含较多的天门冬氨酸、谷氨酸等酸性氨基酸，是酸性蛋白，带负电荷。

由于核蛋白的核酸与生物遗传和蛋白质生物合成关系密切，因此有关核蛋白结构与功能的研究十分活跃。如烟草斑纹病毒、小儿麻痹症病毒、流行性感冒病毒等动植物病毒本身就是核蛋白，因此核蛋白的研究在动、植物病害的防治及临床医学上有十分重要意义。

一类由蛋白质和核酸结合而成的复合蛋白质。存在于一切生物。病毒是一类极简单的生物，它们的化学本质就是核蛋白。细胞中核蛋白主要存在于染色体和核糖体中。由于核酸有DNA和RNA两类，核蛋白也因而分为DNA-核蛋白和RNA-核蛋白两类。DNA-核蛋白主要存在于细胞核内，RNA-核蛋白主要存在于核糖体中。两类核蛋白的许多理化性质相似，都能被碱性染料染色，都不稳定，在热或碱的作用下易分解为核酸及蛋白质。DNA-核蛋白的粘性较强，不溶于等渗食盐溶液，溶于离子强度极低的盐溶液；RNA-核蛋白能溶于等渗食盐溶液。组成核蛋白的蛋白质部分主要是组蛋白和精蛋白等碱性蛋白，也有其他蛋白质如烟草花叶病毒的蛋白质，这种蛋白质分子极大，每个分子由2130条肽链组成，每天肽链的分子量为1.75万。

核蛋白在遗传及蛋白质合成中起着决定性作用，也是生物体内某些病毒和噬菌体的惟一组成成分。