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核蛋白結合蛋白質中的一類。普遍存在於各種生物的細胞核中的特殊形態的蛋白質，由核酸與組蛋白、精蛋白等的鹼性蛋白結合而成為細胞核的主要成分。根據核酸種類不同，可分為核糖核酸核蛋白和脫氧核糖核酸核蛋白。可從細胞核中提取得到，能溶解於1mol/L NaCl溶液中。核蛋白中的蛋白質包括組蛋白(或精蛋白)和非組蛋白蛋白質。組蛋白含鹼性氨基酸如精氨酸、賴氨酸等豐富的鹼性蛋白，帶正電荷。精蛋白僅出現於真核細胞中，含較多的天門冬氨酸、穀氨酸等酸性氨基酸，是酸性蛋白，帶負電荷。

由於核蛋白的核酸與生物遺傳和蛋白質生物合成關係密切，因此有關核蛋白結構與功能的研究十分活躍。如煙草斑紋病毒、小兒麻痹症病毒、流行性感冒病毒等動植物病毒本身就是核蛋白，因此核蛋白的研究在動、植物病害的防治及臨床醫學上有十分重要意義。

一類由蛋白質和核酸結合而成的複合蛋白質。存在於一切生物。病毒是一類極簡單的生物，它們的化學本質就是核蛋白。細胞中核蛋白主要存在於染色體和核糖體中。由於核酸有DNA和RNA兩類，核蛋白也因而分為DNA-核蛋白和RNA-核蛋白兩類。DNA-核蛋白主要存在於細胞核內，RNA-核蛋白主要存在於核糖體中。兩類核蛋白的許多理化性質相似，都能被鹼性染料染色，都不穩定，在熱或鹼的作用下易分解為核酸及蛋白質。DNA-核蛋白的粘性較強，不溶於等滲食鹽溶液，溶於離子強度極低的鹽溶液；RNA-核蛋白能溶於等滲食鹽溶液。組成核蛋白的蛋白質部分主要是組蛋白和精蛋白等鹼性蛋白，也有其他蛋白質如煙草花葉病毒的蛋白質，這種蛋白質分子極大，每個分子由2130條肽鏈組成，每天肽鏈的分子量為1.75萬。

核蛋白在遺傳及蛋白質合成中起着決定性作用，也是生物體內某些病毒和噬菌體的惟一組成成分。