余珂檢視原始碼討論檢視歷史
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余珂，男，北京大學深圳研究生院教授。
人物簡歷
2016年7月至今，北京大學環能學院，助理教授，博士生導師；
2014年至2016年，加州大學伯克利分校博士後；
2014年博士畢業於香港大學。
研究方向
關注於地表水環境微生物組及微生物在環境工程系統中的應用，開展由地表至地下的極端環境微生物組研究，開發1）痕量遺傳物質採集、提取及測序技術，2）以信息學技術為支撐的多組學高精度數據解析和定向富集培養技術，及3）耦合合成微生物學和合成生態學的微生物群落改造或強化技術，以此發掘地球演化過程中的罕見或特殊微生物類群及其在特殊生物製劑生產、環境修復與改造中的應用潛能，進一步探討可用於地外行星環境改造的先鋒微生物類群。
科研項目
1. 2021，代謝調控導向的微生物組-宿主-藥物互作網絡與信號傳遞機理，國家重點研發計劃「生物大分子與微生物組」重點專項（項目編號2021YFA1301300），子課題負責人
2. 2020年，黃河甘寧蒙段典型污染物對魚類生存繁衍的潛在影響及參與生態流量研究，國家自然科學基金重點項目（項目編號：51939009），協助單位負責人
3. 2019年，解譯驅動抗生素抗性產生的關鍵環境誘變因子及抗性產生機制，國家自然科學基金面上基金項目（項目編號2110333321），協助單位負責人
4. 2018年，基於多維組學技術解譯厭氧氨氧化細菌對亞硝酸鹽脅迫與分子氧脅迫響應的分子機制，國家自然科學基金青年科學基金項目（項目編號51709005），主持
學術成果
共發表SCI論文42篇，其中以第一作者或通訊作者身份在Microbiome，Environmental Science & Technology 等環境領域頂級期刊上發表 SCI 論文 15 篇。第一作者或通訊作者文章中最高影響因子為16.837（2021年影響因子），平均影響因子為 7.017。論文他引總數 3000 余次，其中單篇最高他引300餘次，其中包括2篇論文發表於環境微生物的頂級期刊Microbiome雜誌（影響因子16.837）。其中，以第一作者發表的世界上首篇應用宏轉錄組技術解析活性污泥微生物的論文，被丹麥奧爾本大學的世界污水處理微生物的權威專家Per H Nielsen教授上評為近50年來解析活性污泥微生物生態的20篇里程碑式研究技術型論文之一；另一篇多宏組學技術論文被佐治亞理工大學的著名分子生物學及細胞生物學講席教授Marvin Whiteley評價為革新了菌間互作研究的方法，為未來研究提供了嶄新的途徑。部分代表論文如下：
（1） Ray Keren#, Jennifer Lawrence#, Wei-Qin Zhuang, David Jenkins, Jillian F Banfield, Lisa Alvarez-Cohen, Lijie Zhou*, Ke Yu*. Increased replication rates of dissimilatory nitrogen-reducing bacteria leads to decreased anammox reactor performance. Microbiome, 2020, 8:6.
（2） Ke Yu*#, Shan Yi#, Bing Li, Feng Guo, Xingxing Peng, Zhiping Wang, Yang Wu, Lisa Alvarez-Cohen and Tong Zhang*. An integrated meta-omics approach reveals substrates involved in synergistic interactions in a bisphenol A (BPA)- degrading microbial community. Microbiome, 2019, 7: 16.
（3） Chunfang Deng#, Renxin Zhao, Zhiguang Qiu, Bing Li*, Tong Zhang, Feng Guo, Rong Mu, Yang Wu, Xuejiao Qiao, Liyu Zhang, Jay J Cheng, Jinren Ni, Ke Yu*. Genome-centric metagenomics provides new insights into the microbial community and metabolic potential of landfill leachate microbiota. Sci. Total Env., 2022, 816:151635.
（4） Xuejiao Qiao#, Liyu Zhang, Zhiguang Qiu, Li Wang, Yang Wu, Chunfang Deng, Jia Su, Xue Zhang, Yuexing Wang, Bing Li, Lijie Zhou, Anthony YW Ma, Wei-Qin Zhuang, Ke Yu*. Specific Denitrifying and Dissimilatory Nitrate Reduction to Ammonium Bacteria Assisted the Recovery of Anammox Community From Nitrite Inhibition. Frontiers in Microbiology, 2021, 781156-781156.
（5） Yang Wu#, Yuexing Wang, Yashika G. De Costa, Zhida Tong, Jay Cheng, Lijie Zhou, Weiqin Zhuang*, Ke Yu*. The co-existence of anammox genera in an expanded granular sludge bed reactor with biomass carriers for nitrogen removal. Applied Microbiology and Biotechnology, 2019, 103, 1231-1242.
（6） Yujie Men*#, Ke Yu#, Jacob Bælum, Ying Gao, Julien Tremblay, Emmanuel Prestat, Ben Stenuit, Susannah G. Tringe, Janet Jansson, Tong Zhang, and Lisa Alvarez-Cohen. Metagenomic and metatranscriptomic analyses reveal structure and dynamics of a dechlorinating community containing Dehalococcoides mccartyi and corrinoid-providing microorganisms under cobalamin-limited condition. Applied and Environmental Microbiology, 2017, 83(8): e03508-16.
（7） Chen Lianguo#, Yu Ke#, Huang Changjiang, Yu Liqin, Zhu Bingqing, Lam Paul K. S., Lam James C. W., Zhou Bingsheng*. Prenatal transfer of polybrominated diphenyl ethers (PBDEs) results in developmental neurotoxicity in zebrafish larvae. Environmental Science & Technology, 2012, 46, 9727-9734.
（8） Yu K#, Zhang T (2012). Metagenomic and metatranscriptomic analysis of microbial community structure and gene expression of activated sludge. PLoS ONE 7(5): e38183.
該論文被丹麥奧爾本大學（Aalborg University）的世界污水處理微生物的權威專家Per H Nielsen教授在2013年的「Microbial Ecology and Water Engineering Specialist Conference」 (MEWE)上評為近50年來，解析活性污泥微生物生態的研究技術型論文中的12篇里程碑式論文之一。
預印版代表論文
（1） Yu K*#, Qiu ZG#, Mu R#, Qiao XJ#, Zhang LY#, Lian CA, Deng CF, Wu Y, Li B, Zhang YZ, Fan L, Liu YX, Cao HL, Chen BW, Wang F, Yan Y, Zhang T, Zhuang WQ. Recovery of high-qualitied Genomes from a deep-inland Salt Lake Using BASALT. BioRxiv, 2021, doi.org/10.1101/2021.03.05.434042.[1]