周翰林檢視原始碼討論檢視歷史
周翰林
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工作經歷
2011年獲中山大學水生生物學碩士學位。2011-2017年在深圳華大基因研究院擔任生物信息分析員，使用高通量測序技術和生信方法研究遺傳病，包括遺傳變異檢測的生信分析方法和流程開發，致病基因和位點的檢測、科研解讀與報告。2017-2021年在丹麥哥本哈根大學就讀，獲分子生物醫學專業博士學位，使用單細胞轉錄組技術對乳腺癌新輔助化療病人的腫瘤組織及外周血單核細胞進行研究，揭示新輔助化療重塑血液循環系統和腫瘤局部的免疫微環境。2021-2022年在深圳華大生命科學研究院擔任生物信息研究員，利用單細胞多組學以及空間多組學技術研究腫瘤免疫微環境，以及開發單細胞分析新算法和工具。2022年7月至今任復旦大學人類表型組研究院青年副研究員。
研究方向
1）腫瘤微環境研究。利用多組學技術和單細胞技術以及空間組學技術研究惡性腫瘤、腫瘤轉移以及腫瘤微環境中各類細胞的表型和特徵，挖掘新的生物標記物和治療靶點。
2）空間多組學技術的開發和優化、新算法的開發，以及示範項目和隊列的開展。空間組學是連接分子到宏觀表型的橋樑，空間組學的研究將着力於分子在器官的精確定位，將有助於深入地探究器官功能，發育和病變機理，從而為疾病的防治提供的科學依據。
代表論文
1、K. X. Xiong*, H. L. Zhou*♯, C. Lin, J. H. Yin, K. Kristiansen, H. M. Yang and G. B. Li♯ (2022). "Chord: an ensemble machine learning algorithm to identify doublets in single-cell RNA sequencing data." Commun Biol 5(1): 510. (*Co-first author, ♯Co-corresponding author)
2、H. L. Zhou*, G. Li*, J. Yin*, T. Wang*, H. Hu*, T. Li*, Q. Zhou, J. Hu, L. Wang, S. Dong, C. Wei, C. Zhang, Y. Lu, W. Zhou, C. Huang, H. Yang, D. Zhou, L. Wang and K. Wu (2021). "Neoadjuvant chemotherapy alters peripheral and tumour-infiltrating immune cells in breast cancer revealed by single-cell RNA sequencing." Clin Transl Med 11(12): e621.
3、Shi, Q., K. Shao, H. Jia, B. Cao, W. Li, S. Dong, J. Liu, K. Wu, M. Liu, F. Liu, H. L. Zhou, J. Lv, F. Gu, L. Li, S. Zhu, S. Li, G. Li and L. Fu (2022). "Genomic alterations and evolution of cell clusters in metastatic invasive micropapillary carcinoma of the breast." Nat Commun 13(1): 111.
4、Wang, L., Q. F. Lin, H. Y. Wang, J. Guan, L. Lan, L. Y. Xie, L. Yu, J. Yang, C. Zhao, J. L. Liang, H. L. H. L. Zhou. M. Yang, W. P. Xiong, Q. J. Zhang, D. Y. Wang and Q. J. Wang (2017). "Clinical Auditory Phenotypes Associated with GATA3 Gene Mutations in Familial Hypoparathyroidism-deafness-renal Dysplasia Syndrome." Chin Med J (Engl) 130(6): 703-709.