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純合子（別名：純合體、同型綜合子、同型結合體）指同源染色體在同一基因座上的兩個等位基因相同的基因型個體。
純合子有顯性純合子和隱形純合子兩種類型。其中顯性純合子是指同源染色體上同基因座上的兩個等位基因完全相同顯性基因的個體。隱形純合子是指同源染色體上同基因座上的兩個等位基因完全相同隱性基因的個體。[1]
基本內容
純合子亦稱同型接合體。就所研究的若干基因而言，其具有相對關係的全部基因在機能和位點上都相同的接合體稱為純合子。一對相對基因有AA和aa兩種基因型的個體，二對相對基因則有AABB，AAbb，aaBB，aabb四種基因型的個體。這種狀態稱為同型。原則上純合子不會由於自交而分離出具有不同遺傳因子的個體，因而可以用這種方法加以確定。全部基因都是同型的個體為純系，通過反覆自交或同系交配進行選擇，可以得到純合子。
純合子就是指自交後代不發生性狀分離的個體 所以AABB，AAbb，aaBB，aabb都是純合子。
注意的是基因型如AAbb類的物種是純合子，但不能單純的說是顯性純合子或者隱性純合子，因為它既有隱性基因也有顯性基因。
另外對XY染色體上的非同源部分的基因型進行討論時，既不能說是純合子，也不能說是雜合子，因為其並不具備「兩個等位基因」這一條件。如雄性白眼果蠅的基因型為，它既不是純合子，也不是雜合子。
新含義：純合子可用來指近親相交形成的產物， 智力與適應力均較低。[2]
純合子和雜合子怎樣區別
純合子與雜合子在遺傳上是兩個重要的概念，要透徹理解這兩個概念必須從它們的內涵入手．具有相同基因的配子結合成的合子發育成的個體稱純合子；具有不同基因的配子結合成的合子發育成的個體稱雜合子．