花蓮河川
花蓮縣是一個依山傍水的好地方，西有中央山脈山勢險峻，東有太平洋海納百川，縱谷內花蓮溪和秀姑巒溪源遠流長穿梭其間，處處可見美景，以前秀姑巒溪與花蓮溪是同一條河流，一路從台東海端鄉向北奔流，在現今的花蓮溪口流入太平洋，叫做「古花蓮溪」，但在瑞穗鄉有一條小河叫做「古奇美溪」，因為河川向源侵蝕切穿海岸山脈，致使古花蓮溪瑞穗以上河段之溪水順勢流入古奇美溪，才成為今日的「秀姑巒溪」。
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花蓮溪
花蓮溪(原名紅巖溪)位於台灣東部花蓮縣境內，北與太魯閣河系流域相接，西鄰 濁水溪流域，南與秀姑巒溪流域接壤，東隔豐棧沿海河系流域。花蓮溪發源於中央山脈之拔子山(標高1,755公尺)，於大豐山附近出谷入平原後沿海岸山脈西麓 流經光復鄉、鳳林鎮、壽豐鄉及吉安鄉，於花蓮市南濱入太平洋；流域面積約 1,507平方公里，本流全長約57公里，河床平均坡降約1/285。 流域內重要支流有光復溪、馬鞍溪、萬里溪、壽豐溪及木瓜溪等，涵蓋花蓮縣光 復、鳳林、壽豐、吉安及花蓮等五個鄉(鎮、市)行政區。
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木瓜溪
木瓜溪發源於高聳的能高南山、奇萊主山及其南峰，因為木瓜山聳立在該溪進入平原的要口而將其命名為「木瓜溪」。木瓜溪是花蓮溪的主要支流之一，位於花蓮溪在花蓮縣境內的最北端，流域面積1,507平方公里為最大支流。溪流左、右岸土壤肥沃及縱谷平原的地理環境，造就了豐饒的農業，是吉安鄉及壽豐鄉主要的農業生產區域，就業人口中高度賴以為生。 其下游自銅門大橋以下，為遊客由花蓮進入鯉魚潭的必經路線，中游左岸榕樹部落的榕樹堤防段，為進入著名慕谷慕魚的入口門戶，遊客經常停留聚集，鯉魚潭風景區因其具有天然的湖光山色，長期以來為花蓮當地居民及各地遊客所喜愛之景點之一。
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壽豐溪
壽豐溪位於台灣東岸花蓮縣境內的溪流。為花蓮溪支流，原名知亞干溪，源頭來自中央山脈中段，為壽豐鄉與鳳林鎮的鄉鎮界河。此溪盛產奇石，上遊河床處有範圍廣且出泉量多，名為二子山野溪溫泉，是全台最大溪溫泉，下游在溪口村兆豐農場東方處匯入花蓮溪。溪
萬里溪
萬里溪又稱萬里橋溪，舊稱馬里勿溪或森坂溪，為花蓮溪的支流之一。該溪發源自中央山脈白石山與安東軍山等山東側萬里池，流經花蓮縣萬榮鄉與鳳林鎮兩鄉鎮，在鳳林鎮箭瑛大橋前注入花蓮溪。 萬里溪流域中，林田山地區過去以台灣林業重要的林場著名，而今日為重要的觀光景點。此外，位於萬里溪中游的萬榮溫泉亦是重要的觀光景點。
馬太鞍溪
馬鞍溪原名馬太鞍溪，是花蓮溪支流之一，發源自丹大山北邊，流經花蓮縣萬榮鄉、鳳林鎮與光復鄉等鄉鎮，為鳳林鎮與光復鄉之界河，與光復溪匯流後為花蓮溪。位於馬鞍溪沖積扇的馬太鞍濕地，目前規劃成生態保留區。上緣的馬太鞍部落以馬太鞍豐年舞祭而聞名。
光復溪
秀姑巒溪
秀姑巒溪位於台灣東部花蓮縣境內，北與花蓮溪、豐濱溪流域相接，西鄰濁水溪、高屏溪流域，南與卑南溪流域接壤，東隔長濱沿海河系流域。秀姑巒溪發源於中央山脈崙天山南麓(標高2,360公尺)，東流入花東縱谷後，受海岸山脈阻擋，轉沿縱谷平原向北流，沿途匯納兩側支流，至玉里與支流樂樂溪匯流後河道逐漸加寬，於流經瑞穗大橋收納支流富源溪後，折轉向東流，並以其巨大侵蝕力橫切海岸山脈，河寬乍然縮成百米峽谷，在豐濱鄉大港口附近流入太平洋。流域面積約1,790平方公里，主流全長約81公里，河床平均降坡約1/34。 流域內有重要支流樂樂溪、卓溪、豐坪溪、紅葉溪及富源溪等，涵蓋花蓮縣富里、卓溪、玉里、瑞穗、萬榮、光復、豐濱、台東縣海端及池上等九個鄉(鎮、市)行政區。 「秀姑巒」是由阿美族話「奚卜蘭」演譯過而來，原來的意思是指長虹橋一帶出海的「河口」，這本來是港口村的舊名，後來衍為溪名和山名。 阿美族是秀姑巒溪流域歷史最久的原住民，日治時期強迫布農族遷至秀姑巒溪西側，同時也在秀姑巒溪中游玉里的長良里建立日本移民村，清朝晚期才有漢人漸漸移入。
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樂樂溪
樂樂溪又稱樂庫樂庫溪、拉庫拉庫溪，是秀姑巒溪第一大的支流。樂樂溪本身源流為米亞桑溪，發源於中央山脈最高峰秀姑巒山東側，但整個水系的最遠源流則為其支流馬霍拉斯溪，發源於中央山脈的馬博拉斯山東側。米亞桑溪與發源自達芬尖山的另一支流塔達芬溪合流後，始稱為「樂樂溪」。 當地人稱拉庫拉庫溪，因為地質軟弱容易被水流切割，是「軟石頭」的意思，所以樂樂溪才有很多瀑布和深潭。
豐坪溪
鱉溪
鱉溪位於花蓮縣境內，因昔日甲魚（鱉）蹤跡隨處可見而得名，其發源於海岸山脈，為秀姑巒溪上游長流性支流，主流沿山谷北流，並於富里鄉石平橋 附近匯入秀姑巒溪。主流長 16.91 公里，流域面積 47.96 平方公里河道蜿蜒曲 折，沿線散佈著大小不一的河谷平原，平原區面積合計約 4.7 平方公里，佔全 流域面積的 10%左右。中上游坡度陡峭，週邊林相覆蓋良好，流域土地多屬於 山坡地保留區。主流於石門附近進入花東縱谷平原，坡度減緩，河道型態轉為 蜿蜒曲折，河幅也較寬。鱉溪流域終年水量豐沛，水域生態十分豐富，有臺東間爬岩鰍、菊池氏細鯽、大吻鰕虎等臺灣東部原生魚種。
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紅葉溪
紅葉溪為台灣秀姑巒溪的支流，發源於虎頭山，流經花蓮縣卓溪鄉、萬榮鄉與瑞穗鄉等鄉鎮，匯入秀姑巒溪。 紅葉溪最著名的是分別位於河兩岸的紅葉溫泉與瑞穗溫泉，此二溫泉與安通溫泉並稱花東縱谷三大溫泉。紅葉溪為台灣最長的溫泉河。[1]
富源溪
富源溪又名麻子漏溪，舊稱馬蘭鉤溪，為台灣秀姑巒溪北側的支流，發源於倫太文山南麓及沙武巒山北麓，流經花蓮縣萬榮鄉與瑞穗鄉兩鄉鎮，至瑞穗鄉瑞美村東方匯入秀姑巒溪。 富源溪上游設立有富源森林遊樂區，其中以蝴蝶谷與富源瀑布聞名。