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遺傳圖譜

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遺傳圖譜是某一物種的染色體圖，顯示所知的基因和/或遺傳標記的相對位置，而不是在每條染色體上特殊的物理位置。由遺傳重組測驗結果推算出來的、在一條染色體上可以發生的突變座位的直線排列（基因位點的排列）圖。

Genetic map，遺傳圖或遺傳連鎖圖是以基因連鎖、重組交換值構建的圖譜，圖距為cM（厘摩），1%交換值為1cM，約相當於1000kb。人基因組全長約3300cM，如兩個標記之間相距1cM，則需3300個標記，如相距2～5cM，則需660～l650個標記。標記可以是體質性狀，也可以是可檢出的DNA序列，例如基因、限制片段長度多態性（RFLP）和特定的單一序列等。每一個標記都要用專一序列位點（STS）作鑑定。STS是指其位置及核苷酸序列均已知的、人基因組中只有一份拷貝的DNA短片段（一般長200～500鹼基對），它很容易用多聚酶鏈反應（PCR）加以驗證。當各個實驗室報道定位和測序的數據時，可用STS來確定這些DNA片段的定位與取向。人類基因組計劃的研究目標是，完成一個完全連接的人類遺傳圖，標記之間平均相距2～5cM。

基本信息

遺傳圖譜即遺傳連鎖圖譜，是基因組研究中的一個重要組成部分，它是指基因組中基因以及專一的多態性標記之間相對位置的圖譜。即通過兩點測驗和三點測驗對統計的各種帶型個體數進行連鎖分析計算，建立連鎖群。也可從第二個標記開始，測驗與前一個標記是否協同分離。根據分離資料，用最大似然法估計不同標記位點間的重組率數值並轉換成遺傳距離，連鎖的遺傳標記間距離，一般用cM表示，1cM為同源染色體配對期望交換值1%的染色體長度。隨着計算機技術的發展，已有多個構建遺傳圖譜的軟件，研究者用的較多的軟件主要有MapMaker及JoinMap 3.0 。

遺傳分析

通過遺傳重組所得到的基因在具體染色體上線性排列圖稱為遺傳連鎖圖。它是通過計算連鎖的遺傳標誌之間的重組頻率，確定他們的相對距離，一般用厘摩來表示。繪製遺傳連鎖圖的方法有很多，但是在DNA多態性技術未開發時，鑑定的連鎖圖很少，隨着DNA多態性的開發，使得可利用的遺傳標誌數目迅速擴增。早期使用的多態性標誌有RFLP（限制性酶切片段長度多態性）、RAPD（隨機引物擴增多態性DNA）、AFLP（擴增片段長度多態性）；80年代後出現的有STR（短串聯重複序列，又稱微衛星）DNA遺傳多態性分析和90年代發展的SNP（單個核苷酸的多態性）分析。利用遺傳圖譜可以對多種疾病及性狀進行遺傳分析與基因定位。

作圖群體

建遺傳圖譜的遺傳材料是分離群體，即作圖群體。按其遺傳穩定性可分為兩大類：一是非固定性分離群體或暫時性群體(F2、F3、F4、BC群體、三交群體)，其最主要的特點是易於在短期內構建具充足大小的作圖群體。二是永久性或固定性的作圖群體，DH和RIL為永久性的作圖群體，它們克服了暫時性群體的不足之處，但構建這樣的群體不是難度大，就是耗時長。

植物圖譜構建

1、親本選擇差異大，子代可穩定遺傳的

2、親本的標記及差異選擇

3、作圖群體構建以及分子標記檢測

4、連鎖分析：兩點測驗、三點測驗（軟件：MAPMAKER）

5、遺傳標記的染色體定位